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多烯大环类抗生素合成酶结构域的差异进化分析及应用于一株产四霉素链霉菌菌株的筛选.pdf
第 29 卷第 1 期
2011 年 2 月
上海交通大学学报(农业科学版〉
JOU议NAL OF SHANGHAI JIAOTONG UNlVERSITY (AGRICULTURAL SCIENCE)
Vol. 29 No.l
Feb. 2011
文章编号: 1671唰9964(2011)01心001-09 001: 10.3969/1. ISSN唰 1671-9964， 2011.0 1. 001
Different Evolution on Domains of Polyene Macrolide Antibiotics Biosynthases
Implying New Insights to Combinational Biosynthesis and Mining
a New Tetramycin Producing Streptomylω5 Strain
]iangWan.旷日 ? Kexuan τàng 2 ? Zixin 胁矿 ? Xí Huang1
0 , Laboratory of Microb也1 Metabolísm and Schoo1 of Life Sciences and Biotechnol唱y. Shanghaí JOO Tong University.
Shanghai 200030.China; 2. P1ant Biotechnology R创创rch Cent哇r. Schoo1 of Agriculture ar对脱。10盯.Shar喀阳i 200240.China;
3. State Key Laboratory of Bioorganic 叫 Natural Products Chenústry. shar嚼Jai Institute of Organic Chenústry,
Chinese Academy of Scíences.345 Lingli哺阳，Shanghaí 200032 , China)
Abstract: Biosynthases of polyene macrolides antibiotic belong to typical type 1 modular polyketide synthases
(PKS).ηleir common struct旧al traits and similar module-biosynthesis suggested the clo配ly evolutional relation-
ship among their biosynthases. In our study. individual domains in each polyene PKS were se!ected to be taken phy-
logenetíc analysis. We found that dífferent kinds of domain..! exhibited dífferent evolutíonal dírection:three groups of
KS domains responsible for thr臼 structural parts of polyenes; duplícatíons or re∞mbination of AT and KR do-
mains mostly happened within one gene cluster while KS and ACP domain exhibiting more tendency to gene hori-
zontal transfer; moreover. the number of co叫ugated double bonds is determined by PKS domains organization.
since FR-008 (Fsc) and pimaricin (Pim) maybe came from one common ancesω巳Based on the high similarity be叩
tween Fsc and Pim,one gene-ba!ed screen method has successfully identified a new tetramycin-producing strepω-
myces stram.
Key words: 仰lyene antibiotic; domain; dífferent evolution; PKS; tetramycin
多烯大环类抗生素合成酶结构域的差异进化分析及
应用于一株产四霉素链霉茵茵株的筛选
玉给1.川，唐克轩2 ，邓
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