茂原链霉菌DSM 40847全基因组测序及序列分析.pdfVIP

基因组学与应用生物学 ，????年 ，第 ??卷，第 ?期‘第 ???—???页? ????????????????????????????，????，???．??，??．?，???— ???? 研 究论 文? ????????????????? 茂原链霉菌 ?????????全基 因组测序及序列分析? 肖前程 ? 彭 思露? 李 尔汉 ? 朱 笃?，? 杨 慧林? ?江西师范大学生命科学学院，江西省亚热带植物资源保护与利用重 点实验 室，南昌，??????；?江西科 技师范大学生命科学学院，江西省有机? 功能分子重点实验室，南 昌，??????? 通讯作者，?????????????????．???? 摘 要 茂 原链 霉 菌??????????????????????????是 一种 高 ??含量 的革兰 氏阳性 放线 菌 ，它 广泛 用 于生 产 转? 谷氨酰胺酶、博来霉素、莫能霉素等。目前，还没有相关研究报道茂原链霉菌的全基因组序列，这限制了基于? 功能基 因挖掘 和利 用 的定 向育 种 以及 分 子遗 传研 究 。本 研 究 首次 通过 高 通量 测序 技 术对 茂 原链 霉 菌 ???? ?????进 行全 基 因组 测序 ，使用 ??????软件 进行拼 接得 到 ???????????，整个基 因组 大小 约 ?．????，??含 量为? ??．?％，序列 己提 交至美 国国立生 物技 术信 息 中?????????的 ???????数据 库 。通过 对基 因 组序列 进 行分 析 ，? 成功鉴 定转 谷氨 酰胺 酶酶 原激活 相关 蛋 白基因 ，同时对 该 菌株 的次级代 谢 产物合 成基 因簇 进行 了预测 ，相 关? 研究 结果将 为茂 原链 霉菌 的功 能基 因组学 研究 提供基 础数 据 。? 关键词? 茂 原链 霉菌．全基 因组 测序，转谷氨 酰胺 酶，基 因簇? ? ??????????? ?????????????????????????????????????????????????????????? ??????????? ??????? ??????????????? ????????? ????????? ???????????????????????? ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????，??????????? ?????????????，? ????????，??????；????? ????????????????????????????????? ?????，??? ???????????? ????????????