病毒生态学研究进展.PDFVIP

第 ３６ 卷第 １６ 期 生 态 学 报 Ｖｏｌ．３６，Ｎｏ．１６ ２０１６年８月 ＡＣＴＡ ＥＣＯＬＯＧＩＣＡ ＳＩＮＩＣＡ Ａｕｇ．，２０１６ ＤＯＩ：１０．５８４６／ ｓｔｘｂ２０１５０１２１０１７０ 韩丽丽，贺纪正．病毒生态学研究进展．生态学报，２０１６，３６（１６）：４９８８⁃４９９６． Ｈａｎ Ｌ Ｌ，ＨｅＪ Ｚ．Ａｄｖａｎｃｅｓ ｉｎ ｖｉｒａｌ ｅｃｏｌｏｇｙ ｒｅｓｅａｒｃｈ．Ａｃｔａ Ｅｃｏｌｏｇｉｃａ Ｓｉｎｉｃａ，２０１６，３６（１６）：４９８８⁃４９９６． 病毒生态学研究进展 韩丽丽，贺纪正∗ 中国科学院生态环境研究中心　 城市与区域生态国家重点实验室，北京　 １０００８５ 摘要：病毒是目前所知的最简单的生命单元，通常由外壳蛋白和包裹在外壳蛋白内的核酸两部分组成。 病毒本身缺乏完整的酶 系统及能量转化系统，当游离于环境中时，它只是一个有机大分子，只有侵染宿主后才具有生命特征，进行复制。 病毒也是地球 上最丰富的生物实体，是微生物群落和功能的重要影响因素。 尽管病毒在生态系统中发挥着重要的作用，但因病毒间缺少通用 的标记基因，病毒生态学的研究远远滞后于细菌和真核生物。 近年来高通量测序技术的发展应用帮助人们发现和认识了许多 未知的新病毒及其基因，极大地丰富了病毒基因数据库，直接推动了病毒生态学的发展。 从生态学角度对病毒的结构与分类、 病毒生态学研究方法、病毒的生态功能及土壤病毒生态学研究进展作一简要综述，并提出今后土壤病毒生态学研究的重点。 关键词：病毒；多样性；基因水平转移；生物地球化学循环；土壤环境 Ａｄｖａｎｃｅｓ ｉｎ ｖｉｒａｌ ｅｃｏｌｏｇｙ ｒｅｓｅａｒｃｈ ＨＡＮ Ｌｉｌｉ，ＨＥ Ｊｉｚｈｅｎｇ∗ Ｓｔａｔｅ ＫｅｙＬａｂｏｒａｔｏｒｙ ｏｆ ＵｒｂａｎａｎｄＲｅｇｉｏｎａｌＥｃｏｌｏｇｙ，Ｒｅｓｅａｒｃｈ ＣｅｎｔｅｒｆｏｒＥｃｏ⁃ＥｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌＳｃｉｅｎｃｅｓ，ＣｈｉｎｅｓｅＡｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｂｅｉｊｉｎｇ １０００８５，Ｃｈｉｎａ Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｖｉｒｕｓｅｓ ａｒｅ ｕｓｕａｌｌｙ ｃｏｍｐｏｓｅｄ ｏｆ ａ ｓｍａｌｌ ｆｒａｇｍｅｎｔ ｏｆ ｎｕｃｌｅｉｃ ａｃｉｄ （ＤＮＡ ｏｒ ＲＮＡ） ｓｕｒｒｏｕｎｄｅｄ ｂｙ ｃｏａｔ ｐｒｏｔｅｉｎ， ａｎｄ ｈａｖｅ ｂｅｅｎ ｒｅｃｏｇｎｉｚｅｄ ａｓ ｔｈｅ ｓｉｍｐｌｅｓｔ ｌｉｖｉｎｇ ｏｒｇａｎｉｓｍｓ ｋｎｏｗｎ ｔｈｕｓ ｆａｒ． Ｖｉｒｕｓｅｓ ｅｘｉｓｔ ｏｎｌｙ ａｓ ｏｒｇａｎｉｃ ｍａｃｒｏｍｏｌｅｃｕｌｅｓ ｗｈｅｎ ｉｎ ｔｈｅ ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔ，ｂｅｃａｕｓｅ ｔｈｅｙ ｌａｃｋ ｉｎｔｅｇｒａｌ ｅｎｚｙｍｅ ａｎｄ ｅｎｅｒｇｙ ｔｒａｎｓｆｏｒｍａｔｉｏｎ ｓｙｓｔｅｍｓ． Ｈｏｗｅｖｅｒ，ｏｎｃｅ ｔｈｅｙ ｉｎｆｅｃｔ ｈｏｓｔ ｃｅｌｌｓ，ｖｉｒｕｓｅｓｂｅｃｏｍｅａｃｔｉｖｅａｎｄｂｅｇｉｎｔｏｒｅｐｌｉｃａｔｅ．Ｄｅｓｐｉｔｅｔｈｅｉｒｄｅｐｅｎｄｅｎｃｅｏｎｈｏｓｔｃｅｌｌｓｔｏｒｅｐｒｏｄｕｃｅ，ｖｉｒｕｓｅｓａｒｅｔｈｅ ｍｏｓｔ ｕｂｉｑｕｉｔｏｕｓ ｌｉｖｉｎｇ ｏｒｇａｎｉｓｍｓ， ａｎｄ ｉｍｐｏｒｔａｎｔ ｄｒｉｖｅｒｓ ｉｎｆｌｕｅｎｃｉｎｇ ｍｉｃｒｏｂｉａｌ ｃｏｍｍｕｎｉｔｉｅｓ ａｎｄ ｅｃｏｓｙｓｔｅｍ ｆｕｎｃｔｉｏｎｉｎｇ． Ｈｏｗｅｖｅｒ，ｏｕｒｕｎｄｅｒｓｔａｎｄｉｎｇｏｆｔｈｅｍｉｃｒｏｂｉａｌｅｃｏｌｏｇｙｏｆｖｉｒｕｓｅｓｉｎｔｈｅｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔｈａｓｎｏｔｋｅｐｔｐａｃｅｗｉｔｈｔｈｅｒａｐｉｄａｄｖａｎｃｅｓ ｏｆ ｓｔｕｄｉｅｓ ｏｎ ｂａｃｔｅｒｉａ ａｎｄ ｅｕｋａｒｙｏｔｅｓ，ｏｗｉｎｇ ｔｏ ｔｈｅ ｌａｃｋ ｏｆ ａ ｕｎｉｖｅｒｓａｌ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｂｉｏｍａｒｋｅｒ． ８