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第八章酶的人工模拟.ppt
第八章 酶的人工模拟 第一节 模拟酶的理论 一.模拟酶(mimic enzyme)的概念 设计和合成一些较天然酶简单的非蛋白分子或蛋白质分子,以这些分子作为模型来模拟酶对其作用底物的结合和催化过程。模拟酶又称人工酶或酶模型。 设计模拟酶 催化基团 与底物定向结合的能力。 酶模型的催化基团和底物之间必须具有相互匹配的立体化学特征 主-客体”化学(host-guest chemistry) Cram提出:主体与客体通过配位键或其它次级键形成稳定复合物的化学领域称为“主-客体”化学(host-guest chemistry)。 本质上,主-客体化学的基本意义来源于酶和底物的相互作用,体现为主体和客体在结合部位的空间及电子排列的互补,这种主客体互补与酶和它所识别的底物结合情况近似。 超分子化学 超分子:底物和受体的结合, 非共价键相互作用,如静电作用、氢键和范德华力等。 具有分子识别、催化和选择性输出的功能。 由于Cram、Pederson和Lehn在人们长期寻求合成与天然蛋白质功能一样的有机化合物方面取得了开拓性成果,由此获得1987年诺贝尔化学奖。 第二节 模拟酶的分类 模拟酶可分为: (1)单纯酶模型(enzyme-based mimics),即以化学方法通过天然酶活性的模拟来重建和改造酶活性; (2)机理酶模型(mechanism-based mimics),即通过对酶作用机制诸如识别、结合和过渡态稳定化的认识,来指导酶模型的设计和合成;(3)单纯合成的酶样化合物(synzyme),即一些化学合成的具有酶样催化活性的简单分子。 按照模拟酶的属性,模拟酶可分为: (1)主—客体酶模型,包括环糊精、冠醚、穴醚、杂环大环化合物和卟啉类等; (2)胶束酶模型; (3)肽酶; (4)抗体酶; (5)分子印迹酶模型; (6)半合成酶等。 一.主-客体模型 1.环糊精模拟酶 环糊精由淀粉通过环糊精葡萄糖基转移酶降解制得 是由D-吡喃葡萄糖单元以α-1,4-糖苷键相互结合成互为椅式构象的环状低聚糖,其分子通常含有6~12个吡喃葡萄糖单元。 有实用意义的是含6、7、8个吡喃葡萄糖单元的α、β、γ-环糊精,但α-环糊精空腔较小,γ-环糊精价格昂贵,常用的是β-环糊精 ①水解酶的模拟 Bender等人将实现了电荷中继系统的酰基酶催化部位引入CD的第二面,成功地制备出人工酶β-Benzyme 。 二茂铁:二聚环戊烯铁 ②核糖核酸酶的模拟 牛胰核糖核酸酶 :124 氨基酸残基 His12, His119, Lys41在它的催化下RNA的磷酸酯水解分两步进行,两个咪唑基交替起着广义酸碱催化的作用。 二.胶束模拟酶 三、 肽酶 (pepzyme) 四.半合成酶 以天然蛋白或酶为母体,用化学或生物学方法引进适当的活性部位或催化基团,或改变其结构从而形成一种新的“人工酶”。 通过选择性修饰氨基酸侧链将一种氨基酸侧链化学转化为另一种新的氨基酸侧链称为化学诱变法。 Bender等人首次成功地将枯草杆菌蛋白酶活性部位的丝氨酸(Ser)残基,经苯甲基磺酰氟特异性活化后,再用巯基化合物取代,将丝氨酸转化为半胱氨酸。虽然产生的巯基化枯草杆菌蛋白酶对肽或酯没有水解活力,但能水解高度活化的底物,如硝基苯酯等。 Hilvert等人利用类似的方法,将枯草杆菌蛋白酶结合部位的特异性Ser突变为硒代半胱氨酸。此硒化枯草杆菌蛋白酶既表现出转氨酶的活性又表现出含硒谷胱甘肽过氧化物酶活性。 五、抗体酶 1.概念 抗体酶又称催化性抗体,是一种具有催化功能的抗体分子,在其可变区赋予了酶属性。 抗原:一种进入机体后能刺激机体产生免疫反应的物质,是引起免疫反应的外因。 半抗原:与抗原机理类似,但由于分子量较小不能单独刺激肌体产生免疫反应的化合物。 仅具有免疫反应性,而无免疫原性的物质,称为半抗原。类脂质与大多数多糖均为半抗原。半抗原若与蛋白质结合后,便具有免疫原性,而成为完全抗原。 凡是有抗原性的物质通称为抗原。抗原性通常包括免疫原性和反应原性两个方面。 ----免疫原性--能刺激机体产生抗体,或诱异机体形成免疫应答的特征 ----反应原性--能与其所诱导而产生的抗体或致敏淋巴细胞发生反应,或激发机体发生免疫应答,此性质称反应原性。 抗体:即免疫球蛋白。机体的免疫系统因外来的入侵而产生的保护性分子,它能与抗原特异地结合。 单克隆抗体:单一克隆产生的并对某种抗原具有特异性的均一性抗体,它可通过单克隆抗体技术(即杂交瘤技术)人工制备。 2.历史 1948年Pauling的预言: 酶的催化作用是由于酶在催化化学反应过程中,活性中心同底物的过渡态或高能反应中间体产生互补,从而加速化学反应的进行。
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