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基于质谱分析的定性蛋白质组学方法                           齐孟文  中国农业大学  现代质谱是蛋白质分析与研究的基本实验技术，这里简要介绍有关蛋白质鉴 定的质谱原理、实验平台，及其质谱解析算法，以期对相关领域的技术线路和实 验方法有一基本了解。 1.现代生物质谱的一般结构 生物质谱得益于两种软电离技术的发展，即基质辅助激光解吸电离(MALDI) 和电喷雾电离（ESI）。 图.MALDI 电离原理示意图，一般得到单价的正离子。孙汉昌，2011，蛋白质组 质谱数据处理关键问题与技术研究。 图.ESI 电离的示意图，一般得到多价态的离子。图片来自，孙汉昌，2011，蛋 白质组质谱数据处理关键问题与技术研究。 2.定性蛋白组学的实验平台 图.ABI 4700质谱仪组成、常用实验策略和数据处理。图片来自张记阳，2007， 蛋白质组学中串联质谱数据搜库结果质量控制方法研究。 图.LTQ-Orbitrap质谱平台及常用实验流程。图片来自张记阳，2007，蛋白质组 学中串联质谱数据搜库结果质量控制方法研究。 3. 蛋白质