第七章原核基因表达调控1.pptVIP

转录单元 Most bacterial promoters have –35 and –10 elements（ consensus sequences ） Some have UP element Some lack –35 element, but have extended –10 region -35 element -10 element (Pribnow box) UP element pre –10 element +1 Transcription start +1 转录的起始—启动子(Promoter) 转录的起始—RNA聚合酶(RNA polymerase) 　 基因 作用 全酶 α2ββ’ σ 　 催化rRNA、 tRNA和 mRNA的合成的起始 核心酶 α2ββ’ 　 延伸 α 　 rpoA 酶的组装，解旋与再螺旋 β 　 rpoB 酶催化中心 β’ 　 rpoC 酶催化中心 σ 　 rpoD 识别特异启动子 大肠杆的的RNA聚合酶：由5个亚基组成，即α2ββ’σ，有时还有2个ω 亚基。以α2ββ’σ组成的酶称全酶。 σ亚基与其他亚基结合较松弛，易从全酶（holoenzyme）上解离；其余部分α2ββ’称为核心酶(core enzyme) 大肠杆菌RNA聚合酶 原核生物转录起始 s 因子 功能：识别启动子、起始转录 E.coli 中存在多种 s 因子 大部分基因的表达需要s70 特定条件下需要不同的s 因子 s54：氮源利用 s32：热休克 s 因子功能 s70 promoters in E.coli The –35 and –10 sequences of individual s factors are conserved (yellow boxes) The spacer sequence between –35 and –10 is not conserved, but the spacer length is 17?1 bp The 3D structure of bacterial RNA polymerase holoenzyme N-term s1 Inhibition s2 -10 binding s3 -10 binding s4 -35 binding s factor domains : s3 启动子调节— 抑制（I） 空间构象阻碍：lac operon，trp operon 抑制开放型复合物的形成、启动子清除等 DNA binding domain Tetramerization helix Core N subdomain Core C subdomain Inducer binding pocket Hinge helix 乳糖操纵子阻遏蛋白单体 -82 +11 lac repressor -35 -10 -82 +11 乳糖操纵子阻遏蛋白四聚体 (IPTG) IPTG的诱导作用 anti-s factor -10 -35 RNAP s -10 -35 RNAP s anti-s 启动子调节— 抑制（II） Anti-activation：抑制分子去除激活分子的效应 weak promoter +1 weak promoter ABS +1 ABS RNA pol - s Activator RNA pol - s Activator Repressor Activator binding sequence 启动子调节— 抑制（III） 启动子调节— 激活（I） CAP结合于启动子上游，有利于形成稳定的开放型启动子-RNA 聚合酶结构 激活分子的结合 s54 s54 ATP ATP+Pi 启动子调节— 激活（II） RNA聚合酶激活 启动子调节— 激活（III） 启动子激活：MerR activated promoters TPP结合的BmrR激活转录，而BmrR则不能 转录的终止—终止子(terminator) 终止子(terminator) DNA上提供转录停止信号的一段序列称为终止子，是一个基因的末端或是一个操纵子的末端的一段特定序列。 强终止子：不依赖于Rho因子 弱终止子：依赖于Rho因子才能实现终止作用 终止序列的特点： 1）回文结构（转录的mRNA形成茎环状的发夹结构）； 2）回文结构富含G-C； 3）回文序列的下游常有 6—8个AU对 依赖子ρ因子的终止子回文序列中GC对含量较少，回文序列下方没有固定结构，其AU对含量也较低，因而是