第三章基因组医学分子生物学,20119,2011级研究生.pptVIP

SNPs 可以位于基因编码区或非编码区 SNPs发生的频率很高 about 1 in 1000 bases to 1 in 100 to 300 bases. SNPs 可作为检测基因遗传变异的标记 SNPs 位于某基因的附近可作为该基因的基因标记 位于基因编码区的SNPs会或不会改变蛋白质的结构 尽管1944年，Avery的细菌转化实验已证明DNA是遗传物质，但当时的反对者仍然认为蛋白质才是转化因子，毕竟无荚膜肺炎双球菌经DNA转化产生荚膜只涉及个别现象，而证明携带噬菌体遗传物质是DNA则更具普遍意义。Watson是“噬菌体小组”中最年轻的成员，1950年在Luria指导下取得博士学位，其年22岁。1951年在剑桥遇到正在M.Perutz小组作研究生的Crick，两人便开始合作探求DNA的分子结构。 5. 真核基因组中含有大量重复顺序。 6. 真核基因组中非编码序列（non-coding sequence, NCS) 占90%以上。 7. 真核生物的结构基因是断裂基因(split gene)。 8. 真核生物基因组中有假基因存在。 9. 功能相关的基因构成各种基因家族，它们可串联在一起，也可相距很远（分散在不同染色体上），即使串联在一起的基因也是分别转录的。 第五节基因组变异具有重要的生理和病理意义 一、基因组在进化过程中发生了各种 形式的变异 SNP（single nucleotide polymorphism）定义： 是指单个核苷酸变异而形成DNA分子多态 即单核苷酸多态性 P43 人SNP位点约有300万个之多，远多于其他的DNA多态性，是最具代表性的DNA多态性，一部分与个体的表型差异、对疾病的易感性或抵抗力、对药物的反应性相关，在疾病的诊断，治疗和预防中具有重要意义。 SNP 的分类 编码区SNP 非同义SNP 同义SNP 改变蛋白质 的AA顺序 不改变蛋白质 的AA顺序 基因周边区SNP 基因间SNP （70%～80%） （20%～30%） SNP属于二等位DNA多态性，某位点 要么是A，要么是B。 SNP的应用 基因组作图、亲子鉴定、法医鉴定 疾病的连锁分析、群体遗传学 进化生物学研究等 个体化医学和保健 二、染色体DNA变异可导致疾病的发生 结构基因突变导致蛋白质结构改变、影响功能 结构基因或调控序列突变导致蛋白质合成量的变化，从而影响蛋白质总体活性 非编码序列变异会导致某些疾病发生 三、线粒体基因病受到越来越多的重视 真核生物细胞器基因组特点 线粒体基因组：几乎所有真核生物都有。 叶绿体基因组：能进行光合作用的真核 生物都有。 又称为染色体外基因组，多为环状DNA， 具有多个拷贝。 动物细胞线粒体DNA（mtDNA）含37个编码基因（2个rRNA、22个tRNA、13种蛋白） 目前发现mtDNA50多种点突变及200多种基因组重排与人类疾病相关 线粒体基因病表现为母系遗传 突变基因常仅影响部分mtDNA，存在异质性和阈值效应 mtDNA的基因表达同时受染色体DNA制约 线粒体DNA编码基因排列紧密、无间隔区、部分区域存在重叠 mtDNA突变频率较高，缺乏有效的修复系统及组蛋白的保护 人线粒体基因组 是独立于细胞核染色体外的另一基因组，能自主复制。 编码其自身蛋白质合成体系的某些成员（tRNA，rRNA)及呼吸链的某些成员，其他成员由核基因组编码 闭环双链DNA分子 基因密度大，无内含子 母系遗传 损伤后不易修复 四、易感基因与环境的相互作用 环境基因组学 （the Environmental Genome Prject，EGP ） 其目的在于阐明不同个体对环境因素易感性的差异以及这些差异是如何形成和变化的。 其主要内容是鉴定与环境相关疾病易感基因的等位多态性（allelic polymorphism），及建立这些基因多态性的中心数据库。 第六节基因组学是20世纪末发展起来的一门科学 基因组学（genomics）定义： 是旨在阐明基因组结构、结构与功能的关系以及基因与基因之间的相互作用的科学。 研究内容 结构基因组学structure genomics 功能基因组学functional genomics 比较基因组学comparative genomics 人类基因组的四张图谱 遗传图 genetic map 物理图 physical map DNA 序列图 DNA sequencing 转录图 transcriptional map 人类基因组计划的完成向人们提出了更高的挑战 介绍几种基因 ★ NR2B基因（聪明基因）