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genetics6真核生物的遗传分析

第四章 真核生物的遗传分析 第一节 真核生物基因组 一、基因组与C值 基因组:一个物种单倍体的染色体的数目及其所携带的全部基因称为该物种的基因组(genome)。 C值:一个物种单倍体基因组的DNA含量是相对恒定的,它通常称为该物种DNA的C值。 各类生物基因组的大小 真核生物的基因组比较庞大 人:单倍体基因组3.16×109 bp 按1000个碱基编码一种蛋白质计: 理论上,有300万个基因,实际大概2.5万个基因 说明:有许多DNA序列并不转录成mRNA指导合成蛋白质。 各类生物单倍体DNA含量(C值) C值悖理(C value paradox):C值的大小并不能完全说明生物进化的程度和遗传复杂性的高低,也就是说,物种的C值和它进化复杂性之间没有严格的对应关系。 人类基因组:25 000个基因 N 值悖理 人们将生物的基因数目与生物在进化树上的位置不存在正相关的事实称为N 值悖理 ( N value paradox)或N 值佯谬。 二、真核生物基因组DNA序列的复杂度 复性动力学 通过DNA的变性( denaturation)和复性( renaturation)反应的动力学过程分析DNA序列的性质 复性的速率取决于互补的DNA 序列之间的随机碰撞 C为单链DNA的浓度(单位是每升的核苷酸摩尔数); C0为单链DNA总浓度,即起始浓度 t为时间(单位为s); k为重组速率常数(单位是L/mol·s),k取决于阳离子浓度、温度、片段大小和DNA序列的复杂性。 复性的分数C/C0是起始浓度和经过时间的乘积C0t的函数,这样的函数绘成图称为C0t曲线。 当t=0时,C=C0,表明所有DNA都是单链。 DNA变性后物理性质发生的变化: (1)流体力学的性质发生改变:粘度下 降,而沉降速度增加; (2)提高了对紫外线的吸收能力,此称为 增色效应(hyperchromic effect) 双链DNA的A260=1.00(浓度为50μg/ml时,对波长260nm紫外线的吸收能力); 单链DNA的A260=1.37; 游离碱基或核苷酸的A260=1.60 减色效应(hpochromic effcef)       重复次数 不同生物基因组的C0t/2是不相同的, C0t/2的位置除了决定于基因组的大小以外,还取决于每个基因的核苷酸序列的重复次数,重复次数愈少则复性愈慢, C0t/2的位置愈后;重复次数愈多, C0t/2位置愈前 真核生物基因组序列分类 (一)单拷贝序列(unique sequence)亦称非重复序列(nonrepetitive sequence): 在一个基因组中只有一个拷贝或2-3个拷贝 不同生物基因组中单拷贝序列所占的比例是不同的 原核生物中一般只含有非重复序列 较低等的真核生物中大部分DNA 是单拷贝的。 动物细胞将近50% DNA 是单拷贝序列 植物和两栖类生物中单拷贝DNA序列降低,而中度和高度重复序列增加。 玉米基因组20%为单拷贝序列 (二)中度重复序列(moderately repetitive sequence) 中度重复序列中的重复单位平均长度约300 bp,重复次数为10~ 102,有一些重复次数为103 ~ 105 (三)高度重复序列(highly repetitive sequence) 卫星DNA(satellite DNA) 重复顺序:由2-10bp组成重复单位,重复单位成串排列而成 由于这类序列的碱基组成不同于其他部份,可用等密度梯度离心法将其与主体DNA 分开,因而称为卫星DNA (或随体DNA) 第二节 真菌类的四分子分析与作图 粗糙脉孢菌( Neurospora crassa)也称为红色面包酶是属于子囊菌( ascomycetes)的真菌,属于低等真核生物。 同时具有无性生殖和有性生殖过程 无性繁殖 单倍体世代是多细胞的菌丝体(mycelium),菌丝体上产生分生孢子(conidium)。由分生孢子发芽形成新的菌丝,这是它的无性世代,一般情况下,就是这样循环地进行无性繁殖。 红色面包霉的有性繁殖 1、不同生理类型的菌丝(假定为+型和-型)相互融合,亦称受精,形成双倍体的合子。 2、两种不同生理类型的菌丝都能产生分生孢子和原子囊果,原子囊果相当于卵细胞,分生孢子相当于精细胞。当“+”交配型(接合型)与“-”交配型融合和受精以后,形成双倍体的合子。 合子形成以后,立即进行减数分裂,产生四个单倍体的核,称为四分孢子。四分孢子再各进行一次有丝分裂,形成8个子囊孢子。这样,每个子囊里的8个孢子有4个为“+”交配型,4个为“-”交配型,二者总是1:1分离。

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