第4讲 生物信息学序列分析提交序列.ppt

研究生课程—生物信息学 杭州师范大学生命与环境科学学院 向太和 第四讲 提交序列 一、如何向核酸数据库提交序列？ 1、序列数据提交途径方式和方式 提交单位：1. The National Center for Biotechnology Information(NCBI)()；2. The DNA Databank of Japan(DDBJ)(www.ddbj.nig.ac.jp)；3. The Europe Molecular Biology Laboratory(EMBL)/ EBI Nucleotide Sequence Database (http://www.embl-heidelberg.de)。 网页提交：/BankIt 。 通过Sequin软件提交(Ftp:///sequin)。 Email：gbsub@ 磁盘邮寄：GenBank Submissions, National Center for Biotechnology Information, National Library of Medicine, Bldg. 38A, Room 8N-803, Bethesda, Maryland 20894。 举例说明如何操作——演示！ Seq of ACS2-Zhongnong NO.8 agccccttaa gtttcccaaa ttattgggaa tcaaaaaagg ccataactct atatagtgaa 61 atacacttat ccataaccct aacagtgtca aaacaacaac ctcacgagat gatcactttg 121 gaaaaaaccc acgactcaca tttgagagtt tttgcttttt gattagttac gccttaagaa 181 cttgttaaaa caaacttttg tcaaacaatg gaaattttca tctgatcagg ttgccagaat 241 atgactgatt gacggtcgtc ttgtgtttaa gttgttgcac gaagcatagg ggattgaggc 301 aacggtgagt gtggtgacat gatgtcttcg agtcttcgag atgacaatcg aagttcgagg 361 ctgctttgac gccagcagaa tttttgtttc ttgaccttag ttgttacctc cttgttttga 421 agcacgaagt ttctaatcct ggtgatggaa atgtccattg tattgtcatc catatttgca 481 aaacaaaccc taaaccatcc tggttctgag caatggaatg aagaacctgg tgaaacattt 541 agtttaactt cattgataat cactttccat aatgccattt ctgcttccaa tgtcttctct 601 ttcaaaagat gacgcaaatc catccataaa aataatcctc cacttccttt caaatatcca 661 attccaacct gcacatcatg aacaaaaaac ttagcatttt gaattcggta tagtgtaaca 721 cctttgcatc taaatataaa tttatcacaa cccattaact aacctgagca agcccttttg 781 tgaagtttcg atgacgcgca gcgagttttt cagcactccc agcaagaaag ttgtcgacaa 841 acacatcatc caacaacatc gatgcaatca aatattgagt ttgcgaggag acgaggccaa 901 agcttgacat cttacgagcg catgcaacaa cagcgtcgtt ataagagtag ataataccga 961 cacgaaatcc agggaatccc atgtctttgg ataggctata aacgacatgg acaagatttc 1021 tatcgcattc aatgtcactg ttgtcgatca cttcagagat actaatgaaa ccgggctctg 1081 caaagacagt ggcagcgtag atttcgtcgc acactaagtg gatattcttt tcgttgataa 1141 acgatacagc agtttcaagt gtttgtctat cgtaaaccgt tccgagtg ORF of ACS2(267-668 and 764-1188)