罗氏的微阵列帮助检测出糖尿病的诱因详解.PDFVIP

罗氏的微阵列 帮助检测出糖尿病的诱因 导致基因组紊乱的染色体重排通常是由基因组的低拷贝重复区域引起的。通过 Roche NimbleGen CGH array，研究人员发现胎儿样本中 17q12 染色体区域的周期性重排与小儿肾病和癫 痫有关。 这些结果强调了在小儿疾病（不仅仅是智 苷酸阵列（NimbleGen, 385K, 平均探针间距 力缺陷）中评估染色体变异的重要性，以及染 53bp ）进行的精确绘图表明3 个样本存在微 色体的重复区可能会成为疾病的诱因。 缺失，并伴有部分复制。 基因组紊乱是由基因组低拷贝重复区域 一个有双侧多囊异常肾脏的胎儿在 的非等位同源重组（NAHR）造成的，在新生 17q12 区域缺失了1.8Mb，其中包含了19 个 儿中的发生几率约为1/1000。目前已知许多 基因。已知其中一个基因TCF2 的突变会引起 基因组紊乱的表型是发育迟缓和智力缺陷。因 青年期发作的成人糖尿病（MODY5），及胎 此，基因组紊乱的筛查主要针对认知障碍和周 儿和幼儿期的肾囊性病。在一项研究中，1/3 围神经系统缺陷的患者。 的MODY5 患者都表现出整个TCF2 基因和 周围序列的缺失。 以前的研究利用基于BAC 的微阵列靶定 了130 个重排热点，暗示基因组的这些区域 研究人员利用定制的寡核苷酸阵列 容易发生周期性的微缺失或重复。 （NimbleGen, 385K, 平均探针间距53bp ） 分析了5 位小儿肾病的患者和3 位MODY5 研究人员利用Roche NimbleGen 的微阵 患者，发现5 位小儿肾病的患者中的4 位和 列，发现了与发育迟缓和智力缺陷（MR/DO） 所有3 位MODY5 患者都表现出与胎儿病例 相关的新的基因组紊乱。令人惊讶的是，在 几乎一致的微缺失。 130 个预测的热点区域中，许多都与拷贝数变 异无关。 另外，Roche NimbleGen fine-tiling array CGH 还用来鉴定轻度至中度智力迟钝、癫痫 为了研究“基因组重排是由许多影响基因 和局部皮质发育不良患者中的微复制。 信号通路的区域引起的”这个假说，也为了拓 宽基因组紊乱引发的疾病范围，Mefford 和他 总的来说，这项分析揭示了一系列先天异 的合作者们分析了155 个有着先天异常的胎 常的胎儿样品中的微缺失和复制。17q12 缺 儿尸体标本中的DNA 样本，并通过BAC 失是第一个被鉴定的导致糖尿病发生的基因 array CGH 分析详细的病理学数据。 组紊乱， 这些周期性的微缺失的鉴定对儿童 肾病和早发性II 型糖尿病的诊断、预测和管 根据研究的数据，9 个（6% ）样本确实 理都有着重大的影响。因此，应该在小儿肾病 存在微缺失或微复制，其中8 个被鉴定出存