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DNA条形码技术在生物分类中的应用论文.doc

  DNA条形码技术在生物分类中的应用论文 韦健红,吴文如,喻良文,林小桦,李薇 【摘要】 DNA条形码技术是通过使用DNA序列对物种进行快速、准确识别的技术。目前在动物分类中最常使用的基因序列是线粒体细胞色素C氧化酶Ⅰ亚基(mtCOⅠ)。该技术的出现可以为研究物种的进化规律、遗传变异、系统发育以及生物多样性等提供理论依据。为了让更多非生物分类学研究者了解并将其应用于更多的领域,本文概述了DNA条形码技术的工作流程、技术特点以及在生物分类中的应用和对未来的展望。 【关键词】 DNA条形码;生物分类;线粒体COⅠ基因;物种鉴定;应用分析 )Abstract: DNA barcoding is a taxonomic method that uses a short geic marker in an organism′s DNA to identify it as belonging to a particular species. Currently,it has been y itochondrial cytochrome C oxidase subunit Ⅰ (mtCOⅠ). It could provide a theoretical basis for studying the lay to learn more and apply the technology in more fields. Key y; mitochondrial COⅠ gene; species identification;application analysis 继2002年Tautz等1提出要用DNA序列作为生物分类系统的主要平台,即DNA分类学后,加拿大Guelph大学的动物学家Paul Hebert2,3在2003年就明确提出了DNA条形码(DNA Barcoding)的概念。DNA条形码技术简单地说,就是通过使用一个或一些短的 DNA基因片段作为条形码来对物种进行快速、准确识别的技术。由于该技术具有利用生物种群中的某些遗传保守性很强的DNA片段进行物种鉴定和亲缘关系的定位,了解其分支来源,甚至可以预知其进化方向等诸多用途,使其成为近年来生物分类学家关注的热点。为了让更多非生物分类学研究者熟悉并将其应用于更多的领域.freelura2parameter distance ) 4用于表示不同分类阶元之间的序列变异程度,比较种、属和科 3 个水平上的序列差异, 然后根据计算结果建立NJ 树(neighbourjoining tree),最后依据DNA条形码遗传距离就能对未知标本进行分类和鉴定。 2 DNA条形码的技术特点 DNA条形码技术提供了信息化的分类学标准和有效的生物分类学手段,成为进展最迅速的学科前沿之一。目前它主要应用于生物信息学和分类学领域,该技术具有以下几个特点。 (1)不受发育阶段的影响。同种生物的DNA序列信息在不同的生命周期是相同的,所以该技术检测对象可以是生物生命过程中的每一时期,如虫卵、幼虫、成虫、植物生长的任意生长阶段等,较之传统的方法扩大了研究对象的范围并有利于标准化的实现。 (2)不受个体形态特征的影响。传统分类对各种形态特征齐全的标本的依赖,对于被子植物来说,根据缺少花果的标本,很难正确鉴定。应用DNA条形码技术分类即使当样本受损也不会影响识别结果,而且还能准确地辨别形态相似性很高的物种。 (3)不受物种的限制。一个标准DNA条形码数据库一但建立,可使各种物种的鉴定成为可能,不限于濒危物种、土著物种或入侵种等。 (4)可以鉴定出许多群体中普遍存在的隐存分类单元。 (5)获取信息量大。可通过建立DNA条形码数据库,一次快速鉴定大量样本。 (6)精确性高。DNA条形码技术利用碱基ACTG组成的序列使物种鉴别数字化。这种数据库使得全球范围内的现生物种能够很准确的鉴定出来。这种技术相对于表形标记鉴定方法。分子标记鉴定技术具有更加准确、可靠、客观的特点。 (7)操作方法简便并且高效容易掌握。不要求具备很精准的生物专业技术,便于交叉学科的研究者能很好运用该技术,从而加快生物分类的进程。 3 DNA条形码的应用 作为一种新兴的物种鉴定方法以及上述诸多的优势和特点,使基因条码技术具有巨大的应用潜力,在鉴定物种、发现隐存种、系统发育等生物多样性研究中发挥了极其显著的作用。 3.1 鉴定物种的范围扩大 DNA条码技术已为研究和利用地球上众多的生物资源,鉴定生物多样性提供了强大的工具,目前,DNA条形码已广泛用于各物种的鉴定与分类。Min等5,6对Asycota、Basidiomycota、Chytridiomycota的31个真菌物种细胞色素C氧化酶Ⅰ基因(COⅠ)进行了研究,结果显示

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