ABCA1基因R219K多态性在汉族与壮族人群中的分布论文.docVIP

　　ABCA1基因R219K多态性在汉族与壮族人群中的分布论文 黄健，李红艳，戴玲，马义丽，胡春萍，马广仁，于详远，黄俊峰.freelorphism in the Han and Zhuang populations. METHODS: The polymerase chain reaction  restriction fragment length polymorphism (PCRRFLP) technique ine ABCA1 gene R219K polymorphism G→A (Arg219Lys) in 127 unrelated healthy Han persons and 103 unrelated healthy Zhuang individuals. χ2 test inority any population (P 0.01). CONCLUSION: The frequencies of ABCA1 gene R219K genotypes and alleles in Han population are not different from Zhuang minority in Guangxi Zhuang Autonomous Region of China, but are very different from Hesperian population. The data imply the association of the single nucleotide polymorphism etabolism and the susceptibility to coronary atherosclerotic heart disease and can be orphism, single nucleotide; han nationality; zhuang ethnic group 0 引言 ATP结合框转运子(ATPbinding cassette transporter, ABC)存在于不同的组织，属于一组利用ATP作为能量来运输不同物质到细胞内外或不同的细胞器上的跨膜蛋白质，ABCA1是ABC超家族的成员之一，其主要功能是参与胆固醇逆转运. ABCA1基因变异与丹吉尔病（Tangier disease,.freelily HDL deficiency，FHD)的发生密切相关. 本文研究中国汉族和壮族人群ABCA1基因R219K多态性的分布特征，并与德国人群进行比较，探讨ABCA1基因R219K多态性的分布差异和特征. 1 对象和方法 1.1 对象 调查血样采自无血缘关系的广西本地区体检健康的人群，其中汉族127（男31，女96）人，壮族103（男26，女77）人. 1.2 方法 1.2.1 基因组DNA提取与PCR检测全血用EDTA抗凝，使用标准的酚氯仿提取法提取白细胞DNA，溶于TE，备用. PCR检测所用引物设计参考国外有关文献［1］. PCR体系为25 μL，含有基因组DNA 0.1~0.3 μg，上游和下游引物分别为10 pmol/L，dNTP mix 0.25 mmol/L，Taq 酶0.5 U，10×缓冲液2.5 μL，MgCl2 20 mmol/L及灭菌去离子水适量，应用自动循环仪进行扩增. 扩增条件：预变性94℃ 4 min，反应循环：变性94℃ 50 s、退火58℃ 50 s，延伸72℃ 1 min，循环32次；最后72℃延伸10 min. 1.2.2 限制性片断长度多态(RFLP)分析上述聚合酶链反应产物用限制性核酸内切酶XagⅠ(MBI,Fermentas)37℃酶切2~3 h. 反应液终体积20 μL，PCR反应产物10 μL，XagⅠ内切酶10 U. 酶切产物用50 bp ladder在20 g/L琼脂糖凝胶中,于恒压（5 V/cm）进行同步电泳,溴乙锭染色，在UVP凝胶成像系统下观察电泳结果并确定基因型. 统计学处理： 计算各组基因型及等位基因频率，并用χ2检验，按Hardyorphism, SNPs）较低频率者在群体中的频率不小于1%. 而在人类DNA多态性中，单核苷酸多态性占大约90%［4］ . 在转录区的SNP称为cSNP(coding regions SNP)，也常称为功能多态性(functional polymorphism)，人类基因组有25~40万个cSNP，由于它在标记功能基因和研究基因的遗传效应等方面具有重要意义，cSNP的研究更受关注. ABCA1基因位于9q31，长度149 kb，含有1453 bp启动子、146 581 bp外显子和内含子(外显子50个，内含子49个)等［