逆转座子序列插入.PDF

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2017-06-20 发布于江苏
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逆转座子序列插入

逆转座子序列插入 ——海湾扇贝过氧化物还原酶V 第1 内含子分析 1,2 1 1 , , (1. , 266071; 2. , 100049) 摘要: 根据海湾扇贝(Argopecten irradians )过氧化物还原酶V(AiPrxV) 的cDNA 序列和部分基因组DNA 序列设计引物, 采用基因组步移方法扩增获得其第 1 内含子(I1) 完整序列, 并通过 Blast 比对、 DNAMAN 和RepFind 搜索进行序列分析。AiPrxV I1 长8 565bp, 占AiPrxV 基因全长的 68%, AT%显著高于GC% 。在5 900~6 700bp 的区域中包含了不完整的编码区, 经分析与文昌鱼、海胆的逆转录酶有极高的相似性, 其N 端与多种动植物逆转座子的逆转录酶C 端具有相似特征。此外, 发现AiPrxV I1 中包含283 个重复序列, 在3 500~4 000bp 和6 800~7 200bp 区域尤为密集。以上特点提示海湾扇贝过氧化物还原酶V 第 1 内含子可能是由一个非长末端重复元件逆转座子(non-LTR retrotransposons)插入, 逐渐演变而形成的。关键词: 海湾扇贝(Argopecten irradians ); 过氧化物还原酶V; 内含子; 逆转座子; 非长末端重复元件中图分类号: S917 文献标识码: A 文章编号: 1000-3096(2013)02-0001-06 , , (catalase) 30 A (short interspersed elements, SINE) [7], (globin) “ ”, [8] , , (Introns-Early)(Introns-Late) [9]  1978 Doolittle[1]Darnel[2] Argopecten irradians Lamarck , , , 1982 , , , , [10-11] , Cavalier-Smith[3]Palmer Logsdon[4] 1991 , , / V (peroxiredoxin V, PrxV), ,