陕西师范大学 第六届青年教师教学基本功大赛教案设计 蛋白质组学 .doc

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陕西师范大学 第六届青年教师教学基本功大赛教案设计 蛋白质组学

陕西师范大学 第六届青年教师教学基本功大赛教案设计 蛋白质组学 刘清梅 生命科学学院 课程名称 蛋白质组学 课程类别 必修课( )限选课(√)公共任选课( ) 总学时 36 授课专业 生命科学、生物技术、理科基地 授课班级 11级生物技术 任课教师 刘清梅 职称 讲师 学历 博士 章 节 名 称 第七章 生物质谱技术与蛋白质鉴定 第一节 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 第二节 肽质量指纹谱鉴定蛋白质技术 教学目标 知识目标 通过本次课程的学习,掌握生物质谱的基本原理,学会分析质谱图谱,并熟悉样品制备的一般流程,掌握肽质量指纹图谱鉴定蛋白质的原理和具体的实验方法和操作流程,熟悉相关数据库检索的操作 能力目标 通过探究式的学习活动,提高对所学内容归纳总结的能力,并运用所学理论知识科学合理地设计实验,指导实验。 情感目标 养成积极主动的学习习惯和对科学研究的兴趣,以及对科学问题的探究精神,体验学习中的乐趣。 学生特点的分析 《蛋白质组学》是针对大三学生开设的,学生已经学习了《生物化学》,对于本课程中涉及到的生化知识相对比较熟悉,故涉及到相关知识时主要采取引导的方式,让学生对相关知识点进行复习、回顾和总结;但对于本课程涉及到的《基因学》、《细胞学》、,《遗传学》等内容,因为和相关课程教学时间同步,故相对不是很熟悉,需要在教授到相关知识时做一定的补充。 本课程是一门新兴的交叉学科,故在教学中要注意学生的认知特点;首先提出实际问题,启发学生思考解决的方案,再提出相关理论及方法,用具体的实验设计阐明相关方法路线。教学中需更应注重培养学生的钻研能力和分析问题、解决问题的能力。 此外本课程是专业限选课,学生的专业比较复杂,有生命科学、生物技术及理科基地等专业,因此学生对新知识的接受速度和程度也不同,在教学中要注意侧重点的不同,注意对不同程度学生的引导;尽力营造一个轻松的学习环境,让学生带动学生学习。 教学重点、难点及处理措施 重点:生物质谱技术的原理,生物质谱的优点; 难点:基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱的谱图分析,肽质量指纹谱鉴定蛋白质技术的原理、应用; 处理措施:用提问的方式来启发学生,循序渐进、由易到难,同时采用视频及图片对质谱原理进行说明,加深学生的认识; 在质谱图分析的环节,用具体的实例加以说明;同时布置课外作业,让学生自己去检索一篇利用质谱鉴定生物大分子的文献资料,并对该质谱图做出分析和说明。 教材和参考书 教材: 《蛋白质组学:理论与方法》 钱小红、贺福初主编 科学教育出版社 参考书: 《蛋白质组学:从序列到功能》 钱小红、贺福初等译 科学教育出版社 《蛋白质组学研究 : 概念、技术及应用 》 张丽华, 梁振, 张玉奎译 Proteomics (established in 2001, IF 4.132) Molecular and Cellular Proteomics (in 2002, IF 6.92) Journal of Proteome Research (in 2002, IF 4.088) Cancer Genomics Proteomics (in 2004) Clinical proteomics (in 2004, IF 2.592) Current proteomics (in 2004, IF 0.92) Expert review of proteomics (in 2004, IF 3.848) Genomics Proteomics Bioinformatics (in 2003) Comparative biochemistry and physiology. Part D, Genomics proteomics (in 2006) Journal of proteomics bioinformatics (in 2008) Proteomics. Clinical applications (in 2008) 其他相关期刊杂志 教学内容及教学活动的描述 时间分配 回顾:蛋白质组学的研究内容;经典的蛋白质组学的研究方法 蛋白质组学的研究内容:对细胞或组织样本中的蛋白质实现全部的分离、鉴定,最终研究其功能与相互作用网络; 经典的蛋白质组学的研究方法:蛋白质裂解→双向凝胶电泳→染色与扫描→图像分析→质谱鉴定→功能分析→连锁图谱。 通过提问的方式,帮助学生复习已学习的知识点。 2分钟 对质谱的知识进行概述 质谱的原理:样品分子离子化后,根据离子间质荷比(m/z)的差异来分离并确定样品的分子量; 质谱的结构:进样装置、离子化源、质量分析仪、离子检测器、数据分析系统、真空系统; 质谱图:横坐标为m/z,纵坐标为相对丰度; 质谱的发展历史:理论发展阶段

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