分子生物学在大型真菌遗传多样性研究中的应用.pdfVIP

中国食用菌 2008，27 (6)：3~7 CN53-1054／Q ISSN1003-8310 EDIBLE FUNG10FCHINA 分子生物学在大型真菌遗传多样性研究中的应用 张建博 ，桂明英 ，-，刘 蓓 ，马绍宾 (1．云南大学生命科学学院，云南 昆明 650091；2．中华全国供销总社昆明食用菌研究所，云南 昆明 650223) 摘要：大型真菌有着重大的食用、药用价值以及生态学价值。对其进行遗传多样性研究，是进行资源可持续利用和保 护生物学研究的基础。虽然有多种方法可进行大型真菌的遗传多样性研究，但最直接和常用的方法是分子生物学方法。 通过对大型真菌遗传多样性研究中常用的分子生物学方法进行综合分析，比较了各种方法的适用范围和优点、缺点， 以期对这方面的研究有所启发和帮助。 关键词：大型真菌；遗传多样性；遗传标记；分子生物学 中图分类号：$646．9 文献标识码 ：A 文章编号：1003—8310 (2008)06-0003-05 大型真菌是指能产生大型子实体的真菌 ，又称蕈菌 。 性酶切长度 多态 、DNA指纹谱 、建立在 PCR基础上的 大型真菌的子实体较大 、凭 肉眼即可看清 。许多大型真菌 DNA多态性检测技术 、序列分析 、DNA片断标记技术等7[1。 如双孢蘑菇 、香菇 、平菇都是我们常见的食用菌 ；有一些 本文对 目前大型真菌遗传多样性研究中常用到的分子生物 大型真菌如灵芝、虫草等有着较高的药用价值；还有一些 学技术进行了总结，以期为从事相关研究 的科学工作者提 大型真菌对于林地物种多样性及维护生态平衡有很大帮 供一些参考。 助 林 晓民等1J将大型真菌划分为木腐真菌 、落叶及草腐 1 大型真菌 DNA的提取 生真菌 、土壤腐生菌 、粪生真菌 、植物寄生真菌 、昆虫寄 在大型真菌进行分子生物学研究 中，得到完整性好 、 生真菌 、真菌寄生菌 、地衣型真菌 、外生菌根菌 、昆虫共 纯度达到要求的DNA是取得成功的第一步。真菌 的细胞 生菌、天麻共生菌和真菌共生菌等 12个生态类型 。大型 壁结构坚 固，次生代谢产物丰富 ，DNA的提取有一定困 真菌是一类重要的生物资源 ，不但具有巨大的直接经济价 难 。常用的方法有液氮研磨法、CTAB法嗍及氯化苄法等。 值 。而且在生态系统物质与能量循环 、生物协 同进化 中也 张桂敏 、唐文杰等 采用液氮研磨和硅胶破碎相结合的方 具有重大的价值 1【J。 法来提高平菇核 DNA得率 ，并采用亚精胺法纯化提高 要对物种濒危状况进行评估 ，进而采取保护措施和进 DNA的纯度。周小玲 、沈微等㈣介绍了一种适用于多种真 行可持续利用 ，必须充分了解物种遗传多样性 。物种的种 菌 DNA的快速提取方法 ，该方法 的特点是用石英砂振荡 内遗传多样性与其对变化环境 的适应能力密切相关 ，遗传 破壁 ，提取时间仅需 1h~2h。作者应用该方法成功地提 多样性越丰富，物种对环境变化的适应能力越强 ，生存能 取 了粗糙脉胞菌 、米曲霉 、羊肚菌、酿酒酵母等4种不同 力和进化潜力也就越大 。进而也就不容易成为濒危物种 ， 真菌的染色体 DNA，所提 DNA片段均大于20kb，可直接 反之亦然。已有许多研究结果表明，濒危物种的遗传多样 用于限制性内切酶酶切 、PCR扩增等分子生物学研究 。 性普遍低于非濒危物种 l2_。遗传多样性资料在野生动物 、 2 等位酶技术的应用 植物的保护中已得到广泛应用 ，并取得了显著效果。遗传 等位酶在生物界 中普遍存在 ，并以共显性方式表达。 多样性资料在确立濒危物种保护单元 、制定合理保护政策 等位酶技术具有操作简单 、获得结果迅速 、花费较少 、对 等方面发挥了重要作用I41。 实验设备要求不高等优点。通过研究等位酶谱 中的酶带