zinc finger protein 292生物学信息分析 - 生物化学与分子生物学.doc

Zinc finger protein 292生物学信息分析 rueppel C2H2-type锌指蛋白家族成员。其氨基酸序列如下： ZNF292对应基因的染色体定位为6q15，如图1。 图1 ZNF292基因的染色体定位 C2H2型锌指蛋白，是一种经典的锌指结构。它由1个α-螺旋和2个反平衡的β-折叠三个肽段组成，其N端有一组半胱氨酸残基，C端有一组组氨酸残基，四个残基在空间上形成一个洞穴，恰好容纳一个Zn+，形似手指,如图1所示。锌离子能够稳固模体中的α-螺旋结构，使其能够镶嵌于DNA的大沟上。锌指蛋白在基因表达调控中发挥着重要作用，当其与DNA结合后，为DNA结合蛋白(DNA-binding protein)提供一个特殊的结合位点，如图2所示。 图1 C2H2型锌指蛋白，绿色表示Zn2+。 图2 锌指蛋白与DNA结合，橙色表示DNA。 ZNF292蛋白的二级结构及其9个C2H2型的锌指结构，如下图3： 图3 锌指蛋白ZNF292的9个结构域（红色涂影处）：25-49，53-77，344-369，1193-1219，1360-1385，1418-1443，1462-1487，1502-1527，1632-1656。 ZNF292的磷酸化修饰位点进行预测发现，该基因有丝氨酸（Ser）的磷酸化位点89个，苏氨酸(Thr)27个，酪氨酸（Tyr）5个，如下图4： 图4 ZNF292的磷酸化修饰预测位点，红色箭头所指灰色线以上表明其可能的磷酸化修饰位点。 对以上所预测的磷酸化位点以及其相应的分子量和等电点的分析，可以得到以下图5结果： Phosphates Molecular Weight Isoelectric Point 0 218777.2272 8.52 1 218855.1912 8.46 2 218933.1552 8.40 3 219011.1192 8.34 4 219089.0832 8.27 5 219167.0472 8.19 6 219245.0112 8.10 7 219322.9752 8.00 8 219400.9392 7.89 9 219478.9032 7.78 10 219556.8672 7.66 11 219634.8312 7.54 12 219712.7952 7.44 13 219790.7592 7.34 14 219868.7232 7.25 15 219946.6872 7.17 16 220024.6512 7.09 17 220102.6152 7.03 18 220180.5792 6.96 19 220258.5432 6.91 20 220336.5072 6.85 21 220414.4712 6.80 22 220492.4352 6.76 23 220570.3992 6.71 24 220648.3632 6.67 25 220726.3272 6.63 26 220804.2912 6.59 27 220882.2552 6.56 28 220960.2192 6.52 29 221038.1832 6.49 30 221116.1472 6.45 31 221194.1112 6.42 32 221272.0752 6.39 33 221350.0392 6.36 34 221428.0032 6.33 35 221505.9672 6.31 36 221583.9312 6.28 37 221661.8952 6.25 38 221739.8592 6.22 39 221817.8232 6.20 40 221895.7872 6.17 41 221973.7512 6.15 42 222051.7152 6.12 43 222129.6792 6.10 44 222207.6432 6.08 45 222285.6072 6.05 46 222363.5712 6.03 47 222441.5352 6.01 48 222519.4992 5.98 49 222597.4632 5.96 50 222675.4272 5.94 51 222753.3912 5.92 52 222831.3552 5.90 53 222909.3192 5.87 54 222987.2832 5.85 55 223065.2472 5.83 56 223143.2112 5.81 57 223221.1752 5.79 58 223299.1392 5.77 59 223377.1032 5.75