普通油茶泛素结合酶(e2s)的蛋白质结构分析characterization of .pdf

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普通油茶泛素结合酶(e2s)的蛋白质结构分析characterization of

分子植物育种(网络版), 2012 年, 第 10 卷, 第 1376-1382 页 Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2012, Vol.10, 1376-1382 研究报告 Research Report 普通油茶泛素结合酶(E2S)的蛋白质结构分析 林萍 1 , 姚小华 1 , 王开良 1 , 曹永庆 1 , 滕建华 2 1. 中国林科院亚热带林业研究所, 富阳, 311400 2. 浙江省金华市婺城区东方红林场, 金华, 321025 通讯作者: linping80@126.com 作者 分子植物育种, 2012 年, 第 10 卷, 第 51 篇 doi: 10.5376/.2012.10.0051 收稿日期:2012 年 09 月 05 日 接受日期:2012 年 10 月 19 日 发表日期:2012 年 11 月 17 日 这是一篇采用 Creative Commons Attribution License 进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条 件的使用与传播。 引用格式(中文) : 林萍等, 2012, 普通油茶泛素结合酶(E2S)的蛋白质结构分析, 分子植物育种(online) Vol.10 No.51 pp. 1376-1382 (doi: 10.5376/.2012.10.0051) 引用格式(英文) : Lin et al., 2012, Characterization of Ubiquitin-Conjugating Enzyme E2S from Camellia Oleifera, Fenzi Zhiwu Yuzhong (online) (Molecular Plant Breeding) Vol. 10 No.51 pp. 1376-1382 (doi: 10.5376/.2012.10.0051) 摘 要 泛素结合酶(E2)是泛素/26S 蛋白酶体途径中三个关键酶之一,在靶蛋白识别、与泛素连接酶(E3)互作等蛋白的泛素 依赖性水解和 N-末端规则依赖性水解途径的关键环节中起重要作用。本研究采用 Solexa 测序技术获得了一条油茶 E2 的全 长 cDNA 序列,命名为 UBE2S ,该基因编码 270AA,与其它物种的 E2 具有较高的一致性和相似性,UBE2S 蛋白具有泛素 结合酶催化位点(UBCc) ,第 13~145 位氨基酸碱基为其泛素结合酶基因家族的保守区域,第 79~127 位氨基酸残基区域中有 21 个残基与泛素形成硫酯键中间产物的残基,其中 94 位的半胱氨酸残基是活性位点,有 5 个残基是与 E3 酶相互作用的位 点。UBE2S 具有 C 端延伸结构,所以在普通油茶 E2 基因家族中属于 Ⅱ类 E2 。 关键词 普通油茶; 泛素结合酶; solexa 测序; 生物信息学 Characterization of Ubiquitin-Conjugating Enzyme E2S from Camellia Oleifera 1 1 1 1 2 Lin Ping , Yao Xiaohua , Wang Kailiang , Cao Yongqing , Teng Jianhua 1. Research Institute of Subtropical Forestry, Chinese Academy of Forestry, Fuyang, 311400, P.R. China 2. Dongfanghong Forest Farm of Zhejiang Province, Jinhua, 321025, P.R. China Corresponding author, linping80@126.com; Authors Abstract Ubiquitin-co

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