修饰蛋白质组学分离鉴定新技术新方法 - 1809组.pdf

2013 年 第 58 卷 第?期： 1 ~ 10 《中国科学》杂志社 特邀评述 SCIENCE CHINA PRESS 修饰蛋白质组学分离鉴定新技术新方法 ①② ① ① ① ① ① ①* 宋春侠 , 孙珍 , 秦洪强 , 叶明亮 , 张丽华 , 张玉奎 , 邹汉法 ① 中国科学院大连化学物理研究所, 中国科学院分离分析化学重点实验室, 国家色谱研究中心, 大连 116023 ② 中国石油化工股份有限公司石油化工科学研究院, 北京 100083 * 联系人, E-mail: hanfazou@ 2013-05-13 收稿, 2013-07-09 接受 国家自然科学基金委创新研究群体项目和国家重点基础研究发展计划(2013CB911202)资助 摘要 蛋白质翻译后修饰(PTMs)是对基因产物蛋白质进行共价加工的过程, 它是生命体在有 关键词 限基因数目的条件下进行复杂生理学过程调控的重要原因. 生物体内多达300 种的翻译后修饰 蛋白质翻译后 在细胞周期调控、信号传导及免疫应答等众多生命活动中发挥着关键作用. 由于大多数翻译后 修饰 修饰的蛋白质通常具有丰度低、动态范围宽以及结构复杂等特点, 因此对蛋白质翻译后修饰进 磷酸化 糖基化 行规模化分析面临着巨大的挑战. 基于生物质谱技术的修饰蛋白质组学分析方法的出现为翻译 内源性多肽 后修饰蛋白质的高通量分析提供了前所未有的发展契机, 翻译后修饰蛋白质的规模化分析鉴 蛋白质组学 定, 已经成为蛋白质组学研究的核心内容之一. 本文主要针对修饰蛋白质组学常用分析方法, 包括翻译后修饰蛋白质的富集策略、分级方法、质谱鉴定技术和定量分析技术的最新研究进展 进行介绍, 并对其发展前景进行展望. [1,4] 蛋白质翻译后修饰(PTMs)是通过对蛋白质侧链 生出一门新的学科: 修饰蛋白质组学 . 它主要利 和末端进行化学修饰或者是被蛋白水解酶酶切来改 用蛋白质组学分析技术对修饰蛋白质及其位点进行 [1] 变蛋白质性质的共价加工过程 . 生物体内多达 300 鉴定, 对修饰结构进行确认以及对不同生理状态下 种的翻译后修饰在细胞周期调控、信号传导及免疫应 翻译后修饰的变化情况进行定量分析. 该方法的基 答等众多生命活动中发挥着关键作用, 它也是生命 本分析流程如图1所示: 生物样品中的蛋白质经样品 体在有限基因数目的条件下进行复杂生理学过程调 提取后, 在蛋白质层次上进行富集或者直接酶解, 产 控的重要原因. 正是由于基因产物蛋白质的不同剪 生的肽段混合物经过液相色谱预分级, 针对不同修 切类型以及众多翻译后修饰类型的存在, 才使得蛋 饰肽段进行选择性富集后进入质谱分析, 通过数据 [1~3]