基于illumina平台的厚壳贻贝外套膜转录组从头测序 - 浙江大学学报.pdf

浙江大学学报 农业与生命科学版 414 394~406 2015 JournalofZheian Universit A ric LifeSci j g y g htt www ournals zu edu cn ar p j j g E-mail zdxbnsb@zu edu cn DOI 10 3785 issn 1008-9209 2014 12 291 j j 基于Illumina平台的厚壳贻贝外套膜转录组从头测序 鲍林飞 王新星 何健瑜 范美华 高鹏 廖智* 浙江海洋学院海洋科学与技术学院 海洋生物资源及分子工程实验室 浙江 舟山 316022 摘要 为了解贻贝贝壳基质蛋白的分子多样性 采用 高通量测序平台 对厚壳贻贝 外 Illumina M tiluscoruscus y 套膜组织开展转录组文库构建及从头测序研究 总计产出 数据 共 条干净阅读子 经 6970102920nt 序列拼接与组装 获得厚壳贻贝外套膜转录组单一基因共计 个 总长 平均长度 106452 t 519nt N50 达到 并对上述单一基因进行了生物学功能注释和聚类分析 为进一步挖掘贻贝贝壳基质蛋白相关基因 754nt 通过对单一基因的序列注释以及利用已知贝壳基质蛋白序列进行本地搜索 共鉴定出与 种已知贝壳基质蛋白 12 同源的厚壳贻贝外套膜单一基因 条 通过对厚壳贻贝贝壳基质蛋白单一基因进行序列分析和比较 发现厚壳 124 、 贻贝与其他软体动物 如鲍属 牡蛎属和珠母贝属等在贝壳基质蛋白组成以及序列上具有一定的保守性 暗示着 贝壳基质蛋白可能具有共同的起源 同时 首次从贻贝属中发现了 种贝壳棱柱层特异的贝壳基质蛋白单一基 3 因 这为后续贻贝贝壳基质蛋白的大规模鉴定以及对贝壳形成机制的探讨奠定了基础