一个玉米mlo 基因的电子克隆与生物信息学分析 - 玉米科学.pdf

玉 米 科 学 2011 ，19(1)：148～152 Journal%of%Maize%Sciences 文章编号 ： 1005-0906(2011)01-0148-05 一个玉米 Mlo 基因的电子克隆与生物信息学分析 邬晓勇，孙雁霞，何 钢，颜 军，苟小军 (成都大学生物产业学院，成都 610106) % % % % 摘 要 ： Mlo 基因家族在植物抗病方面有极大的优势，但有些 Mlo 基因的功能还未知 。 经序列拼接电子克隆得 到 1 个玉米的 Mlo 基因，采用生物信息学方法预测分析了编码蛋白的一、二、三级结构，并对其功能进行了预测 。 结 果表明：玉米 Mlo 基因编码的蛋白有一个保守的 DUF1084 结构域，此结构域功能在植物中尚未知 。 生物信息学分析 表明，此蛋白很可能是一种类似于 G 蛋白偶联受体的膜结合转运蛋白而参与到信号传递过程中。 关键词 ： 玉米；Mlo 基因；电子克隆；生物信息学 中图分类号： S513 ；Q78% % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % 文献标识码 ： A Analysis of Electronic Clone and Bioinformatics on Mlo Gene from Maize WU%Xiao-yong,%SUN%Yan-xia,%HE%Gang,%YAN%Jun,%GOU%Xiao-jun (Faculty of Bio-Industry of Chengdu University, Chengdu 610106,%China) % % % % Abstract:%Mlo gene%family%has%great%advantages%in%plant%disease%resistance,%but%some%of%the%Mlo gene%function%is% unknown%yet.%A%Mlo gene%was%obtained%by%sequence%splicing%and%electronic%cloned%from%Zea mays(Maize).%The%prima- ry ， secondary%and%tertiary%structure%also%the%function%of%the%encoded%protein%were%analyzed%and%predicted%by%bioinfor- matics%analysis.%The%results%showed%that%the%encoded%protein%had%a%conserved%domain%named%DUF1084%but%its%function% was%unknown%yet%in%plant.%Bioinformatics%analysis%showed%that%the%encoded%protein%may%be%a%membrane-bound%trans- porter%protein%similar%to%the%G%protein-coupled%receptor%and%participate%in%the%process%of%signal%transduction%in%plant. % % % % Key words:%Maize;%Mlo gene;%Electronic%clone;%Bioinformatics 植物在长期的生物进化中形成了一系列复杂而 % % % % 电子克隆法是近年来基于表达序列标签(Ex- 严密的防御机制，使自身免受病原物的侵害[1，2] 。 抗 pressed%Sequence%Tag ，EST)和基因组数据库发展起来