韩海棠《动物生物化学》生化26.docVIP

26、RNA 新陈代谢 26.1 由DNA决定合成的RNA 996 26.2 RNA过程 1007 26.3 由RNA决定合成RNA和DNA部分粒子在细胞质部分“可溶性”的RNA细胞液Francis H. C. Crick，试验生物学专题讨论会文章，1958年 一个基因所表达的信息通常包括一个RNA分子从一个DNA模板转录的结果。一段RNA和DNA乍看起来非常相似，不同的只是RNA在戊醛糖和尿嘧啶的第二位有一个羟基组而不是胸腺嘧啶。然而不同于DNA的是，大部分的RNA以单一链履行它们的职能，它们自身股之间折叠并且有比DNA有着更大结构多样性的潜力（第8章）。因此RNA适应于各种细胞功能。 RNA是唯一已知的在存储和传输信息与催化方面都有作用的高分子化合物。这导致了很多关于其作为一个重要的化学中间体在这个星球的生活发展方面所可能起到的作用的猜测。催化RNA，或核酶的发现，改变了酶的真正定义，将其拓展到了蛋白质范围之外。尽管如此，蛋白质依旧在RNA和它的职能方面不可或缺。在现代细胞中，所有的核酸，包括核糖核酸，是复杂的蛋白质。其中的一些联合体是非常精细的，并且RNA在复杂的生化机器中可以同时起到组成和催化的作用。 除某些病毒的RNA基因组之外的所有RNA分子都源自永久储存在DNA中的遗传信息。在信使核糖核酸的形成过程，一种以与其中的一条DNA链上的碱基序列互补的顺序把一段双链DNA上的基因信息传递到一条RNA链上的酶系统，产生出三种主要类型的RNA。信使核糖核酸（mRNAs）通过一个或一组基因编码一个或多个指定的多肽的氨基酸的排列顺序。转移核糖核酸（tRNAs）转译编码在mRNA上的信息并且在蛋白质合成中转移恰当的氨基酸到逐渐增长的多肽链上。核糖体核糖核酸（rRNAs）是核糖体的组成部分，一种合成蛋白质的精细的细胞机器。许多其他专门的RNA有管理或催化功能或是三种主要类别RNA的前体。 在复制过程中通常是整个染色体被复制，但是转录过程更有选择性。只有一些特定基因或一组基因可以在任何时间转录，而且某些部分的DNA基因组从来没有被转录过。细胞在任何特定的时刻将遗传信息的表达限制在形成所需要的基因产物。精确的管理序列标记被转录的DNA片段的开头和结尾，并指定双工链DNA作为模板。在第28章调节转录中有详细的说明。 在这一章中，我们审查在DNA模板上RNA的合成和反合成处理和RNA分子基板的RNA酶往往是其他的RNA分子。描述了系统中的RNADNA是产品，而不是反之亦然。纯化大肠杆菌的RNA聚合酶α磷酸盐。RNA聚合酶需要DNA激活并且在绑定到双链DNA时最为活跃。如上所述，两条DNA链中只有一条作为模板。模板DNA链的复制是由3’→5’（与新生成的RNA链反平行），就像在DNA复制中一样。新建立的RNA中的每个核苷酸根据沃森-克里克 碱基配对原则选定。RNA上附着的尿嘧啶与DNA上附着的腺嘌呤互补配对，鸟嘌呤与胞嘧啶互补配对，等等。碱基对的几何特征（参阅图25-6）也可在碱基选择中发挥作用。 不同于DNA聚合酶，RNA聚合酶不需要一个前体来引发合成。启动出现在RNA聚合酶结合在一个叫启动子的特定DNA序列上时（见下文）。一个初生的（新近成立）的RNA分子的第一个碱基的5’-三磷酸组不会裂解释放PPI，而是在整个转录过程中保持完整。在转录的延伸阶段，新的DNA链的碱基对的不断增长端暂时与DNA模板形成一个短期杂交的RNA - DNA双螺旋，估计有800 bp的经度α2ββ’ω；Mr390，000）和一个第六亚基，的大型的，复杂的酶，一个聚合指定的σ亚基，和由大小（分子质量）决定的变量。σ亚基短暂结合核心酶并指导酶结合到DNA的特定结合位点（见下文）。这六个单位构成了RNA聚合酶全酶（图26-4）。根据σ单位的类型，大肠杆菌的聚合全酶以这样几种形式存在。最常见的单位是σ70（Mr70，000），而且下面的讨论将重点放在相应的RNA聚合酶全酶上。 由于RNA聚合酶没有核酸外切酶活性，它不能校对新合成的RNA链，因而转录的错误率高于DNA染色体复制的错误——大约每10000-100000个组成RNA的核糖核苷酸就有一个错误。因为RNA的许多副本一般是从单一基因而来而且所有的RNA最终都会退化和被替换，一个RNA分子的错误对细胞所造成的影响远没有一个永久储存的DNA信息的错误严重。许多RNA聚合酶，包括细菌的RNA聚合酶和真核生物的RNA聚合酶Ⅱ（在下文讨论），在转录过程中当一个错误配对的碱基加上时会终止，并且它们可以通过直接逆转聚合酶反应从转录的3’端删除不匹配的碱基。但是，我们还不知道这项活动是否是一个真正的校对功能和它在多大程度上可能有助于高保真转录。σ70的RNA聚合酶全酶所识别）的分析和比较已经在两段短序列-35和-10附近发