绵羊肺炎支原体dnak b 细胞抗原表位预测及其蛋白结构分析.pdf

生物技术通报 ·研究报告· BIOTECHNOLOGY BULLETIN 年第 期 2014 3 绵羊肺炎支原体 DnaK B 细胞抗原表位预测及其 蛋白结构分析 1 3 3 3 1，2 1，2 1，2 1，2 王慧  罗成波  贺纛  孔令萍  周碧君   文明   程振涛   王开功 （1. 贵州大学动物科学学院，贵阳 550025 ；2. 贵州省动物疫病研究室，贵阳 550025 ；3. 黔西南州疫病预防控制中心，兴义 562400） 摘 要 ： 以绵羊肺炎支原体 （Mo ）热休克蛋白Hsp70 （DnaK 蛋白）氨基酸序列为基础，运用DNAStar 软件和在线服务器等 生物信息学分析工具，在同源性分析的基础上，通过Jameson-Wolf 法、Kyte-Doolittle 法、Emini 法、Karplus-Schulz 法及Welling 法 分别预测其抗原指数、亲水性、柔韧性、表面可极性等参数，综合分析、预测了该蛋白的B 细胞抗原表位，并进行了蛋白的二级 结构预测和3D 结构模拟。结果表明，Mo 贵州分离株的Hsp70 蛋白与其它可致羊发病支原体的Hsp70 蛋白同源性较低，说明该蛋 白具有良好的特异性 ；Mo Hsp70 蛋白整体抗原性较好，同时呈现较规则的空间结构，其中以C 末端较稳定，区域也最大 （第394- 598 区段），为优势B 细胞抗原表位区域。 关键词 ： 绵羊肺炎支原体 DnaK 蛋白 蛋白结构 B 细胞抗原表位 Analysis of Structure and B Cell Epitope Predicition of Mycoplasma ovipneumoniae DnaK Protein 1 3 3 3 1，2 1，2 Wang Hui Luo Chengbo He Dao Kong Lingping Zhou Bijun Wen Ming Cheng Zhentao1，2 Wang Kaigong1，2 （1.College of Animal Science ，Guizhou University ，Guiyang 550025 ；2.Laboratory f or Animal Disease of Guizhou ，Guiyang 550025 ； 3. Center f or Animal Disease Control of Qianxinan in Guizhou Province ，Xingyi 562400 ） Abstract:  The study is based on the amino acid sequence of heat shock protein Hsp70 （DnaK protein ）of Mycoplasma ovipneumoniae （Mo ）separatated in guizhou province, using bioinformatics met