中等毒力新城疫病毒ND032026株全基因组遗传特性分析.PDFVIP

　中 国 兽 医 学 报 　2 00 8 年 7 月 　第 28 卷 　第 7 期 　Chin J Vet Sci 　J ul . 2 00 8 　Vol . 2 8 　No . 7 　 743 中等毒力新城疫病毒 ND032026 株全基因组遗传特性分析 1 1 1 2 1 1 3 刘华雷 ,包静月 ,郑东霞 ,孙 旭辉 ,吴延功 ,王志亮 　( 1. 中国动物 卫生与流行病 学中心 , 山东 青岛 2 66032 ;2 . 南京农业大学 动物医学院 ,江苏 南京 2 100 9 5) 摘要 :从 2003 年临床发病鸡群当中分离到 1 株 N DV ,经致病指数测定为中等毒力 。通过 R T2PCR 技术扩增了其 F 基因主要功能区片段 ,并构建了遗传进化树 , 发现其在分类地位上属于基 因 Ⅱ型 ,与我国现用的疫 苗株 L a Sot a 处 于不同的亚群 , 且裂解位点的组成为典型强毒株序列 。对其全基因组序列进行测定 ,结果已登陆 GenBan k , 登录号 为 D 0 60053 。此分离株基因组由 15 186 个核苷酸组成 ,编码 6 种结构蛋白 ,顺序为 3 ′2N P2P2M2F2HN2L25′。通过 对其 6 个编码区进行遗传进化与核苷酸和氨基酸同源性分析 , 结合致病 性结果发现其 与 Ro ak in 毒株的遗传关系 最近 。 关键词 :新城疫病毒 ;中等毒力 ;基因组测序 ;遗传进化 ; 同源性分析 中图分类号 :S85216 5 ; 78 　　　文献标识码 : A 　　　文章编号 : 100524 54 5 (2008) 0720743205 Gen ome an d gen et ic cha ract er izat ion analyses of mesogen ic isola te of Ne wca st le d isea se vir us ND032026 st ra in L IU Hua2lei1 , BA O Ji n g2y ue 1 , Z H EN G Dong2xia 1 , SUN Xu2h ui 2 , WU Ya n2gon g1 , WAN G Zhi2li2 1 3 ( a ng 　 1. Chi na A ni m al H e alt h a n d E pi dem iolo g y Cent er , i n g d a o , S ha n don g 26 6032 , Ch in a ; 2 . Col le ge of V eter in ar y M e d ici ne , N a nj i n g A g r icul t u r al U ni ver si t y , N a nj i ng 2 1009 5 , Chi n a) 　　Abstra ct :One strain o f N ewcast le di sea se viru s (ND V) i solat ed f ro m o utb reak in chicke n in 2003 wa s c har act e r2 ized p athotyp ically an d genotyp ically. The st rain w as me so genic accor ding t o t he p at hogen etic t e st s. The F p rotein p la ys an imp ort an t role in d et er mining th e virulence of N DV str ain s . The main f u nct ional region o f the F gen e w as a mp lified by R T2PCR an