等位基因特异性PCR技术在DEL表型基因分型中的应用.docVIP

等位基因特异性PCR技术在DEL表型基因分型中的应用.doc

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等位基因特异性PCR技术在DEL表型基因分型中的应用.doc

  等位基因特异性PCR技术在DEL表型基因分型中的应用 【摘要】 目的: 建立DEL表型的基因分型方法,用于快速鉴定DEL表型。方法: 用RH Box基因分型方法鉴定标本的基因型,用血清学方法确定标本的DEL表型。根据RHD 1227A等位基因序列设计等位基因特异性聚合酶链反应(allele specificpolymerase chain reaction,ASPCR),用于DEL表型基因分型,结果同血清学的方法作比较,探讨临床应用的可行性。结果: 28例RH Box基因分型为RHD-/RHD-的标本,血清学方法、基因分型方法DEL表型鉴定结果均为阴性;在25例RH Box基因分型为RHD+/RHD-或RHD+/RHD+的标本中,用血清学方法检出的11例DEL表型标本,基因分型方法均扩增到867 bp的1227A等位基因条带;1例血清学方法阴性,而基因分型方法检测为阳性,后经测序分析证实RHD 1227A为阳性,分析此例标本可能为血清学方法漏检。这说明在鉴定DEL表型的方法中基因分型方法比血清学有更高的灵敏度。结论: ASPCR方法可用于临床筛选Rh阴性人群中的DEL表型。 【关键词】 Rh血型 DEL表型; RHD 1227A等位基因; 基因分型   [Abstract] Objective: To establish a genotyping method for DEL phenotype of human blood group system.Methods: The genotype ined by using genotyping method of RH Box, and DEL phenotype ined by serological method. An allelespecific polymerase chain reaction(ASPCR) ethod ethod, the feasibility of the genotyping method in clinical practices ples ethod and genotyping method for DEL phenotype. In 25 RHD+/RHD- and RHD+/RHD+ samples, 11 DEL phenotype positive samples ethod. Hople ethod for DEL genotype. This sample ined positive by sequencing analysis. Genotyping method for DEL phenotype had higher sensitivity than serological method. Conclusion: The ASPCR method can be used for screening DEL phenotype among the population negative of RHD antigen.   [Key l,EDTANa2抗凝,采用试剂盒提取全血DNA(EZBDC血液基因组DNA快提试剂盒,济南泰天和生物科技有限公司),分装-80℃保存备用。   1.4 RHD基因分型   采用RH Box基因分型试剂盒(GT,美国)PCR反应总体积9 μl,含7 μl PCR引物混合液,1 μl DNA样品,1 μl Taq酶(含0.33~0.5单位)。PCR扩增条件:95℃ 30 s,60℃ 30 s,72℃ 90 s,30个循环后置72℃再延长5 min。使用0.5×TBE缓冲液,配制2%琼脂糖凝胶,以10 V/cm电泳30 min,结果通过凝胶成像仪(FR200A全自动紫外与可见分析装置,上海复日科技)拍照成像。   1.5 RHD 1227A基因分型   采用吴俊杰等[5]的方法根据RHD基因和RHD 1227A等位基因相关序列设计一组特异性扩增RHD 1227A等位基因的引物(上海生工生物技术公司合成)。RHDels:5′GACCAAGTTTTCTGGAAA3′(位置对应于AJ299028的6885),RHDela:5′CGAGAGAATTTTGAGCAC3′( 位置对应于AB035185的849832)。一对特异扩增人GAPDH基因240 bp的引物作为内对照,GAPDHF:5′TGATGACATCAAGAAGGTGGTGAAG3′,GAPDHR:5′TCCTTGGAGGCCATGTGGGCCAT3′。总反应体积为10 μl,含模板DNA 0.2 μl,特异性引物终浓度250 nmol/L,内对照引物终浓度50 nmol/L,MgCl

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