牙鲆微卫星标记的开发及多态性分析.pdfVIP

第 卷第 期 水产学报 年 月 文章编号 牙鲆微卫星标记的开发及多态性分析 张潇緆 徐亘博 廖小林 张家波 陈松林 华中农业大学水产学院湖北 武汉 中国水产科学研究院黄海水产研究所农业部海洋渔业可持续发展重点实验室山东 青岛 摘要 将牙鲆基因组经限制性内切酶 和双酶切后采用 法构建酶 切片段基因组文库 共挑取 个克隆 个为阳性克隆阳性克隆率为 经测序 后获得 条微卫星序列其中完美型占 非完美型占 混合型占 用引物设计软件 设计引物 对挑选其中的 对合成并在 个野生牙 鲆个体中进行扩增共 个位点具有多态性统计结果后使用软件进行分析平均 等位基因个数为 平均有效等位基因数为 平均观测杂合度为 平均期 望杂合度为 各引物的 平衡指数在 变动 这些 筛选出的多态性微卫星标记可应用于进一步的牙鲆遗传多样性分析家系分析及遗传图谱的 构建等工作中 关键词 牙鲆 微卫星 多态性 中图分类号 文献标志码 微卫星 又称短串 科 牙鲆属 是一种重要 联重复序列 或简单 的经济鱼类主要分布在我国渤海黄海南海以及 序列重复 目前 朝鲜 日本俄罗斯远东沿岸海区 由于牙鲆经济 由于微卫星具有多态性高共显性等特点 价值高自然资源逐步减少其养殖业迅速发展起 已经被广泛应用于海洋鱼类的遗传多样性分析 来近十年来逐渐成为我国北方乃至南方海域的重 遗传图谱的构建及数量性状连锁分析等工作 国 要增养殖鱼类品种 对于牙鲆微卫星的研究日本 内一些学者相继开展了不同淡海水鱼类微卫星标 学者分离了一些微卫星标记同时将微卫星标记应 记分离多态性分析及其在种质鉴定和遗传结构 用于群体遗传多样性分析 和遗传图谱的构 分析等方面的研究 不过上述方法大多是 建 等 等 也分离了牙鲆微卫星 采取传统技术进行微卫星标记的筛选而传统方 并应用于种群遗传分析 国内也有一些关于牙鲆 法通常都是采用单一限制性内切酶对基因组 微卫星标记筛选的报道以及利用微卫星标记对牙 鲆野生和养殖群体的分析研究的报道 陈微 进行酶切得到阳性克隆的效率较低 有 的采用二次筛选的方法有效地提高了获得微卫星 等 曾用菌落杂交法获得了 个微卫星序列但 有关牙鲆微卫星标记开发的数量仍然较少满足不 序列的效率 但是实验操作较为繁琐 因此 如果能采用双酶切方法进行微卫星标记的筛选 了进行牙鲆高密度遗传连锁图谱构建和定位 那将会提高微卫星标记筛选的效率有利于获得