rivas-eddy rna二级结构图书嵌入分类的实现方法 realization of book embedding for rivas-eddy rna secondary structures.pdfVIP

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2017-09-05 发布于上海
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rivas-eddy rna二级结构图书嵌入分类的实现方法 realization of book embedding for rivas-eddy rna secondary structures.pdf

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rivas-eddy rna二级结构图书嵌入分类的实现方法 realization of book embedding for rivas-eddy rna secondary structures

20 and 2008，44(4) ComputerEngineering Applications计算机工程与应用 RNA二级结构图书嵌入分类的实现方法 Rivas—Eddy 高世乐，丁克诠 GAO Shi-le，DING Ke-quan 大连理工大学电子与信息工程学院，辽宁大连116024 SchoolofElectronicandInformation of 116024，China Engineering，DalianUniversityTechnology，Dalian，Liaoning E—mail：gaoshile@sohu．com GAO ofbook for Sift—le·DING RNA Ke—quan．RealizationembeddingRivas-Eddysecondary and EngineeringApplications。2008。44(4)：20-23． Abstract：Book—thicknessis asa standardto isa cal— regarded classify to topological graphs．Ingeneral，itNP—completeproblem eulatethebook-thicknessofa orembeditintoabook．Inthis schemeis obtained graph paper．abook—embeddingconstructively fortheRNA structuresin class secondary the andthevertex Rivas-Eddybyusingsecondary—structuregraphicgrammar coloring ofthecross-relationthe classificationcanbe furthermore．Thismethodhasa graph。andbook—embedding performed polynomial time can useful referenceto the complexity，whichprovide solvingNP-complete problems． Keywords：Pseudoknots；RNAsecondarystructures；book number；chmmatic embedding；vertexcoloring；clique number；perfectgraphs 摘要：书嵌入数是对图进行分类的一个拓扑标准，通常来说，计算一个图的书嵌入数及给出一种嵌入实例都是NP完全问题。针 RNA分子二级结构图书嵌入的具体实现方法，完成了对RNA分子二级结构的书嵌入分类。该方法具有多项式时间复杂性，为求解NP完全问题提供了有益的参考。关键词：假结；RNA二级结构；书嵌入；点着色；团数；色数；完美图文章编号：1002—8331(2008)04—0020—04文献标识码：A 中图分类号：TP301．2；