基于线粒体控制区的序列变异分析中国东南部沿海凤鲚-生物多样性.pdfVIP

生物多样性 2009, 17 (2): 143–150 doi: 10.3724/SP.J.1003.2009.08286 Biodiversity Science http: // 基于线粒体控制区的序列变异分析中国东南部 沿海凤鲚种群遗传结构 阎雪岚 唐文乔 杨金权* (上海海洋大学鱼类研究室, 上海 201306) 摘要: 为了解中国东南部沿海凤鲚(Coilia mystus) 的种群遗传多样性和遗传结构, 本文分析了长江口(CJ)、钱塘江 口(QT)、闽江口(MJ)和九龙江口(JL)4个凤鲚地理群体的mtDNA控制区561 bp片段的序列变异。65尾样本共检测到 28个单元型。4个群体总的单元型多样性和核苷酸多样性均较高(h = 0.9433 ± 0.0168, π = 0.0317 ± 0.0158), 但单个 群体的核苷酸多样性水平却很低, 其中以CJ最高(π = 0.0080 ± 0.0046), MJ最低(π = 0.0015 ± 0.0013) 。MJ与JL群体 之间以及CJ与QT群体之间的平均K2P遗传距离很小, 分别为0.3%和0.8%; 而CJ、QT分别与MJ 、JL群体之间的遗 传距离均较大, 达到了6% 。采用最大似然法(ML)、最大简约法(MP)和邻接法(NJ)分别构建的单元型间的系统发育 树揭示, 4个凤鲚群体构成CJ-QT 和MJ-JL 2个支系, 且具有极高的支持率。单元型的网络分析也显示这两个支系间 有高达28步的突变次数。AMOVA分析显示大部分的遗传变异来自这两支系群体间(90.77%), 表明凤鲚群体间存在 着显著的地理分化。种群分化指数和基因流分析也表明, 支系间群体有着明显的遗传分化(FST 0.9, Nm 0.03) 。 所有分析结果支持所研究的凤鲚标本属于两个不同的地理种群, 且种群的分化至少已达到亚种水平。采用BEAST 和TRACER软件得到凤鲚两个亚种的最近共同祖先约在0.34–0.46百万年前, 处于更新世晚期, 推测可能是第四纪 晚期的气候旋回和海平面的升降导致了凤鲚的种群分化。 关键词：Coilia mystus, 东南沿海, 线粒体控制区, 遗传多样性, 单系群 Population genetic structure of tapertail anchovy (Coilia mystus) in coastal waters of southeast China based on mtDNA control region se- quences Xuelan Yan, Wenqiao Tang, Jinquan Yang* Laboratory of Fishes, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306 Abstract : To analyze the genetic diversity and genetic structure of Coilia mystus, 65 individuals were sam- pled from four localities, including the Minjiang (MJ), Jiulongjiang (JL), Yangtze (CJ) and Qiantang rivers (QT). Mitochondrial DNA variation was analyzed using 561 bp