汉字文化和生命科学第二篇： 破解谜团的途径--------系统生物学+汉字文化.docxVIP

汉字文化和生命科学第二篇 2.1.破解谜团的途径--------系统生物学+汉字文化1）．解开生命科学中这些谜团的难度现代生物学的发展迅速，学科愈分愈细（把握全局越来越难），越专越深（离开人的直接观察就越来越远）。下面是系统生物学家讲述时涉及的幻灯片：研究的成果数据化，并且：数据量：基因组学，表观基因组学，剪切组学，蛋白质组学，。。。。，数据量爆炸性增长--Big data！大数据时代----------------------------巨量化！数据结构：从树状结构---〉网状结构--------------------------------------------------复杂化！数据表示：照片---〉图片---〉直方图--〉表格---〉数字序列（基因）-----〉抽象化！所以解开生命科学中的这些谜团的难度也就越来越大！面临的困境一方面是基因组，``````等等“组学”信息大爆炸，已发展到了大数据时代，有人把它吹成为现代生命科学的成就标志；另一方面是生命的本质？先天-后天？基因-环境和第三者？生从何来？死去何处？等生命之谜的解答更加遥不可及了！这确实令人啼笑皆非。科学越进步，真相越遥远！这个悖论如何才能破解呢？总的来说，现在的生物学家对这些现象事实是确认的，但其机制，目的就不清楚了！ 现状是这些谜团没有一个合理的解释，生物学界要么归因于“随机”，要么推到“表观遗传学”上，更谈不上有一个统一的机制来解释了。可以用一首中国古诗来描述目前生物界生命科学面临的谜境：题西林壁 （作者：苏轼 年代：宋）横看成岭侧成峰，远近高低各不同。不识庐山真面目，只缘身在此山中。2）． 破解这些谜团的途径—系统生物学要破解这些谜团，应该如何着手呢？还是用中国一首古诗来表达：登鹳雀楼 （作者：王之涣，朝代：唐代）白日依山尽，黄河入海流。欲穷千里目，更上一层楼。更上一层楼，就是我们观察生命世界的立足点要提高，不能一直呆在基因组，剪切组，蛋白质组等”形而下” 层面研究，由此，系统生物学应运而生。系统生物学是研究生命系统各层次组分在时空中发生的相互作用，以发现系统的组织原理、动态行为和涌现属性中规律的学科。它依托大数据，应用数据挖掘技术提取各类特征（涌现），找出因果关联的因素特征链，再一层一层向上推演，最终建立模型。可以说它是一种 “自下向上” 为主（也包含自上而下）的一步一步登高的综合建模方法。下面是系统生物学家讲述时涉及的幻灯片：相比系统生物学这种“自下向上”的登高法, “自上而下”并“自下向上”的综合建模方法理应是更佳的综合方法，那么生物界为什么不采纳此方案呢？下面是系统生物学家演示的幻灯片：由上可见，系统生物学家在介绍此门学科时已提到了这些问题：理论需要整合！为什么说生物学没有理论？真正的理论生物学是什么？但是生物学的理论框架是什么？系统生物学是小科学和大科学综合而来的！这里系统生物学学者提出的‘大科学“，“理论框架”理应是指在整体，总体上，对生命“形而上“（形而上指在可以观察到的生命形态之上！）的能总括生命本质的认识！由上可见，不是学者们不想采用“自下而上”的整合方案，而是目前，系统生物学找不到（或许他们根本不认为会有）一个满意的，可信的“形而上“的生命本质学说才不得不采取“自下而上”的整合方案。为什么系统生物学家说现在的生物学没有理论？因为在生（活与死是怎么一回事）和命（个体生来寿命，贫富，贵贱，敏捷迟钝，热情冷漠等等个体差别的原因）的生命本质问题上西方科学现在没有一个圆满的“形而上”的哲理概括！所以要去整合生物学所发现的种种现象，无从谈起，也无从着手，只好“自下而上”的整合，按目前的进度，基本上在亚细胞级，生物分子级上研究为多，要自下而上一步一步地整合到生物个体这一级，路就还很长，更不用说到生物群体这一级了！好了！那么现在世界上，到底有没有一个圆满的“形而上”的生命哲理概括呢？回答是有也没有，说”有“是我们中国确实有，这对于中国生物学界是件很幸运的事情，说“没有”是指不幸的是我们生物学界不识货，“有”就等于没有。3）．破解这些谜团的途径—系统生物学+汉字文化是故，自上而下 ，并由下向上的综合建模方法的关键是要找到一个“形而上”的生命学说！当然，这个“形而上”的生命学说得符合天理，能担当自上而下的“上”的大学问。它在哪里呢？又是中国的一首古诗！青玉案·元夕 朝代：宋代 作者：辛弃疾东风夜放花千树。更吹落、星如雨。宝马雕车香满路。凤箫声动，玉壶光转，一夜鱼龙舞。 蛾儿雪柳黄金缕。笑语盈盈暗香去。众里寻他千百度。蓦然回首，那人却在，灯火阑珊处。阑珊处指的是人烟稀少、比较冷清的地方。即是一直被不少科学家视为“迷信”，“伪科学”，”垃圾“的非科学的地方！ 无奈乎！不幸乎！实际上，宝贝被当成垃圾，它确实是不幸，；但是，仔细想一想，真正不幸的恰恰是我