生物信息的传(下)的.doc

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生物信息的传(下)的

生物信息的传递(下) ——从mRNA到蛋白质 主要内容 4.1 遗传密码——三联子 4.2 tRNA 4.3 核糖体 4.4 蛋白质合成的生物学机制 4.5 蛋白质转运机制 4.1 遗传密码——三联子 ★密码(三联子密码,codon) mRNA上每3个nt翻译成蛋白质多肽链上的1个AA,这3个nt就成为密码。 ★ORF(可译框架) 由起始密码子开始到终止密码子结束的nt序列 4.1.1 三联子密码及其破译 4.1.1 三联子密码及其破译 以均聚物、随机共聚物和特定序列的共聚物为模板指导多肽合成 1)1961年,Nirenberg: polyU做模板,UUU→Phe polyC做模板,CCC→Pro polyA做模板,AAA→Lys 2) Nirenberg和Ochoa:随机共聚物和特定序列的共聚物为模板 ★以只含A、C的共聚物为模板,任意排列可出现8种三联子: CCC、CCA、CAC、ACC、CAA、ACA、AAC、AAA 获得Asn、His、Pro、Gln、Thr、Lys等6种AA组成得多肽。 ★以多聚二核苷酸做模板可合成由2个AA组成的多肽:PolyUG 5’...UGU GUG UGU GUG UGU GUG …3’ Cys—Val—Cys—Val—Cys—Val ★以多聚三核苷酸做模板:polyUUG 5’…UUG UUG UUG UUG UUG …3’ Trp- Trp- Trp- Trp- Trp 5’… UGU UGU UGU UGU UGU …3’ Cys- Cys- Cys- Cys- Cys 5’… GUU GUU GUU GUU GUU…3’ Val- Val- Val- Val- Val 2. 核糖体结合技术 Nirenberg 和 leder ★ 以人工合成的三核苷酸如UUU等为模板,在含有核糖体、AA-tRNA的适当 离子强度的反应液中保温,然后使反应液通过硝酸纤维素滤膜。 ★游离的AA-tRNA可通过滤膜,与模板和核糖体结合的AA-tRNA留在滤膜上 将游离的AA-tRNA与结合到核糖体上的AA-tRNA分开 ★用20种AA-tRNA作20组实验,每组含有20种AA-tRNA和1种三核苷酸, 只有1种AA用14C标记。 4.1.2 遗传密码的性质 1.密码的连续性:无间断也无重叠 2.密码的简并性(degeneracy) 由一种以上密码子编码同一AA的现象。 编码同一个AA的密码子称为同义密码子 3.密码的通用性与特殊性 通用性:无论在体内还是在体外,无论对病毒、细菌、动物、植物都是通用的 特殊性:少数例外 支原体:UGA→Trp 四膜虫:UAA →Gln 人、牛及酵母线粒体也有例外 线粒体与核DNA密码子使用情况比较 生物 密码子 线粒体DNA编码的AA 核DNA编码的AA 所有 UGA Trp 终止子 酵母 CUA Thr Leu 果蝇 AGA Ser Arg 哺乳动物 AGA/G 终止子 Arg 哺乳动物 AUA Met Ile 4. 密码子与反密码子的相互作用 ★摆动假说 在密码子与反密码子的配对中,前两对严格遵守碱基配对原则,第三个碱基有一定的自由度,可以摆动,可使某些tRNA识别1个以上的密码子。 反密码子的第一位碱基 A C G U I 密码子的第三位碱基 U G U,C A,G A,U,C 4.2 tRNA 结构: 受体臂(acceptor arm)杆状结构, 3’端为CCA, 其余手臂由杆状结构和套索状结构组成 2)TψC臂(ψ表示拟尿嘧啶) 3)反密码子臂 4)D臂,含二氢尿嘧啶(D) 4.2.1 tRNA的L型三级结构 tRNA三级结构与AA-tRNA合成酶对tRNA的是别有关,靠三级氢键维持。 4.2.2 tRNA的功能 是mRNA和AA之间的接合体,起解码作用 4.2.3 tRNA的种类 1. 起始tRNA和延伸tRNA 起始tRNA:特异识别mRNA模板上起始密码子 原核生物:fMet-tRNA 真核生物:Met-tRNA 2. 同工tRNA(cognate tRNA):代表相同AA的tRNA 同工tRNA 均专一于相同的AA-tRNA合成酶 3. 校正tRNA 无义突变(nonsense mutation):在DNA序列中任何导致编码AA的三联密码子转变为终止密码子的突变,它使蛋白质合成提前终止,合成无功能的或无

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