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中药信息学探究进展 　【摘要】 本文对现阶段中药信息学的内容与特点进行了分析。总结了国内外近几年有突破性的中药信息学科研成果,简要介绍了随机森林、自组织映射、分子对接以及构建种质资源进化树等数据挖掘技术在中药信息学中的应用。阐述了结合现代信息技术的中药信息学对中药现代化发展的推动作用。通过实例指出了中药信息资源建设与维护中涉及到民间药物、植物化学、植物分类学等亟待解决的若干问题,同时论述了对中药信息学进行资源拓展的必要性和国际化的发展道路。 【关键词】 中药信息学；中药数据库；数据挖掘；虚拟筛选；国际植物命名法规；异物同名；同物异名 Abstract： Some outstanding progresses of relevant research are summarized, whilst the tasks and features of TCM informatics are discussed. The applications of random forest, self-organizing map, molecular docking and phylogenetic tree built with DNA polymorphism data etc. in TCM informatics are introduced. Some typical issues in the construction and maintenance of TCM database, involving ethnomedicine, phytochemistry and plant taxonomy etc., are also discussed with abundant instances. TCM informatics integrating modern IT techniques motivates the development of TCM. The expansion of sources of TCM informatics and its internationalization is the fastrack of development. 　　Key words：TCM informatics；TCM database；data mining；virtual screening；International Code of Botanical Nomenclature；synonym；homonym 　　为推进中药现代化的发展,科技部、国家计委、国家经贸委、卫生部、国家药品监督管理局、知识产权局、国家中医药管理局、中国科学院在2002年11月制定了中国第一部中药现代化发展的纲领性文件《中药现代化发展纲要(2002年至2010年)》。此纲要明确提出了一系列中药现代化发展的重点任务,其中包括建立中药数据库和种质资源库,收集中药品种、产地、药效等相关的数据；同时要求加强多学科交叉配合,深入进行中药药效物质基础、作用机理、方剂配伍规律等研究,积极开展中药基因组学、蛋白质组学等的研究。要求重视中医药基础理论的研究与创新,特别是与中药现代化发展密切相关的理论研究,如证候理论、组方理论、药性理论,探索其科学内涵,为中药现代化提供发展源泉[1]。经过5年的实践,科技部、卫生部、国家中医药管理局、国家食品药品监督管理局等16个部门在2007年3月又联合发布了《中医药创新发展规划纲要(2006－2020年)》,确定了“继承,创新,现代化,国际化”作为中医药创新发展的基本任务。新纲要明确定义了中医药泛指中华民族传统医药,包括中医药和民族医药。首次提出了在借鉴现代医药和其他国家传统医药经验的基础上,争取使中医药标准规范成为国际传统医药标准规范的战略目标,并且强调中医药基础数据库和国际化信息库的建设,为适应中医药现代化和国际化发展需求建立创新体系,提高科技支撑能力[2]。 　　在这样的政策背景下,中药信息学研究取得了飞速的发展。中药信息学是以计算机为主要工具,首先对蕴藏着大量中药学、化学、药理学和生物医学信息的文献资料进行分析、归类和整编。这包括将中药的原植物、化学成分、药理作用和传统中医药经验理论中的药材性味、方剂配伍、适应症和药效等信息进行数字化处理,再整合大量随机的生物实验和色谱、光谱数据,然后根据研究课题的需要采用适当的数据挖掘方法分析这些数据,从而迅速提取隐含的有价值信息并挖掘出有逻辑性和规律性的知识。这是新的历史条件下中药信息学(TCM informatics)的主要研究内容,也是现代中医药研究的重要组成部分。 　　1 中药信息学发展的新阶段 中药是一个高度复杂的化学