2. 蛋白质结构.ppt

R-CH-COO- R-CH-COO- R-CH-COOH * 两性电离性质和氨基酸分离(离子交换)： pH pI 氨基酸 (+) pH pI 氨基酸 (-) 第三节 蛋白质的分子结构 一、肽键与肽 1. 肽键 (peptide bond)  由肽键两端的6个原子组成（C=O、N-H 相邻氨基酸的R基团呈反式构型 (1) * 氨基酸通过肽键相连的化合物 * 蛋白质水解不完全的产物 (2) 氨基酸残基(amino acid residues) (3) 开链肽: N末端(左,H), 自N端编号 C末端(右,OH) 环肽： (4) 多肽(10肽)、寡肽(10肽)、 5. 重要生理功能/结构特殊的肽 (1) GSH (RBC中,保护膜结构,还原酶蛋白) (p11) (2) TRH (促甲状腺素释放激素) (p11) 6. 多肽与蛋白质区别 (1) 氨基酸残基数(多肽50, 蛋白质100) (2) 空间结构(蛋白质严密, 稳定) (二)蛋白质的二级结构(second structure) 1. 定义： 多肽链中相邻aa残基形成的局部空间结构， 其主链原子(C=O,N-H,Cα)的局部空间排布 3. α螺旋(α-helix)基本特点: 图2--7 a. 肽链骨架 -- 肽键上C、N及aa残基上Cα， 顺时针(N C), 右手螺旋 b. 3.6 aa/螺旋, 螺距0.54nm c. 氢键的形成 -- 上下两个相邻α螺旋之间 (aa1)C=O---H-N(aa5) d. 氢键 -- 与螺旋纵轴平行(3个/相邻螺旋) (α螺旋的主要稳定因素) e. 侧链基团(R)位置 -- 螺旋外 (不参与螺旋组成,但影响螺旋形成与稳定) f. α螺旋 -- 稳定的蛋白质空间构象 (也是最稳定的二级结构) g. 在不同蛋白质中所占比例不同(角蛋白,小分子) 4.β-折叠或β-片层(pleated sheet structure) 比较伸展的肽链空间结构 基本特征: a. 肽键平面之间成锯齿状(110度) b. 氢键维系 a. “U”型结构(肽链1800回折) b. 氢键: (aa1)C=O---H-N(aa4) (结构较α螺旋紧密) c. 位于球蛋白分子表面 6. π-螺旋(π-helix) a. 左手螺旋，4.4个aa残基/螺旋 b. 氢键维系 c. 多见于胶原蛋白 三股左手螺旋 右手超螺旋 胶原纤维 7. 随意卷曲 (random coil) (1)各不相同,无共同规律的空间结构, 是蛋白质中一系列无序构象的总称 (属蛋白质分子的特征性二级结构) (2)普遍存在于天然蛋白质中 例: 膜受体--膜外(N), 膜内, 胞内结构域(C) ? 结构域重要性: * 蛋白质的功能单位，二级与三级结构之间 的重要中间层次 * 结构相对较小，容易研究 (四)蛋白质的三级结构 (tertiary structure) 3. 肌红蛋白(球状,一条链, 153aa,8段) 4. 重要性 一级结构 三级结构 生物活性 三级结构：蛋白质分子最显著特征之一 (五)蛋白质的四级结构(quaternary stucture) 1. 定义： 2. 亚基(subunit): 四级结构中，每个各具独立的三级结构 (六) 维系蛋白质空间构象的次级键 一级结构 --- 共价键 (肽键、二硫键) 空间结构 --- 次级键、二硫键 次级键 --- 键能较低，稳定性差的化学键， 包括：氢键(二级)、疏水键(三级)、盐键(四级) Van der waals引力 图2-19 (二