黄瓜ARF家族序列特征及部分成员在果实发育早期的表达分析.PDFVIP

园 艺 学 报 2011 ，38 （4 ）：717 –724 http: // www. ahs. ac. cn Acta Horticulturae Sinica E-mail: yuanyixuebao@126.com 黄瓜ARF 家族序列特征及部分成员在果实发育 早期的表达分析 * 王 垒，陈劲枫 ，娄丽娜，娄群峰 （作物遗传与种质资源创新国家重点实验室，南京农业大学园艺学院，南京 210095 ） 摘 要：采用生物信息学方法获取黄瓜 ARF 家族信息，并对其进行染色体、序列相似性以及系统进 化树分析，同时选取与单性结实基因亲缘关系较近为主的 9 个 ARF 基因，以单性结实自交系‘6401 ’和 非单性结实自交系‘6429 ’为试材，在花后0、2 和 4 d 取‘6401 ’和‘6429 ’授粉和未授粉两种处理的 果实，利用半定量 RT-PCR 进行表达分析。结果显示：18 个ARF 基因遍布于黄瓜的 7 条染色体上，氨基 酸长度在 172 ~ 1 102 残基之间，相似性在 4.41% ~ 62.12% 的范围内，基因重复、序列差异和基因缺失是 黄瓜 ARF 家族的主要进化模式；基因 Csa021954 和 Csa012805 在果实中受授粉诱导而表达；Csa019265、 Csa009209 和 Csa009210 在所有样品中都有较高的转录本；基因 Csa012237 和 Csa015176 在果实早期发 育中表现出衰减趋势；Csa019264 和 Csa010564 只在发育的果实中表达且表达水平较高，推测这两个基因 的高水平表达可能对果实膨大起促进作用。 关键词：黄瓜；单性结实；ARF ；基因表达；果实；发育 中图分类号：S 641.2 文献标识码：A 文章编号：0513-353X （2011 ）04-0717-08 Sequence Characteristics of ARF Gene Family of Cucumber and an Expression Analysis of Some Members During Early Development of Fruits * WANG Lei ，CHEN Jin-feng ，LOU Li-na ，and LOU Qun-feng （State Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement ，College of Horticulture，Nanjing Agricultural University，Nanjing 210095 ，China） Abstract ：Eighteen ARF family members were identified from Cucumber Genome Datebase using bioinformatics methods. They are distributed on 7 chromosomes ，and their evolutionary patterns are the gene duplication，sequence differences and gene deletion. With RT-PCR technique，parthenocarpic line ‘6401 ’and non-parthenocarpic line ‘6429 ’were used to test the expression patterns of 9 ARF genes that were selected by their homology with genes related parthenocarpy. The results of Csa021954 and Csa012805 indica