核酸的化学结构DNA和RNA是线性的聚合物，由核苷酸-HiNet.ppt

CHAPTER 3 DNA、RNA和蛋白質 DNA、RNA和蛋白質 核酸分子帶著基因訊息 核酸 (nucleic acid) 攜帶基因訊息，其命名是因當初由真核細胞的核中提煉而來。有兩類的核酸分子，一為去氧核糖核酸 (deoxyribonucleic acid, DNA) 與核糖核酸 (ribonucleic acid, RNA)。每個細胞的基因體主要複本儲存在長分子的DNA，其中可能有上千個基因。每個基因是一段長分子的DNA。反之，RNA分子較短，主要用於基因訊息與傳導到細胞機器上的轉換，只攜帶一個或少數的基因。 核酸的化學結構 DNA和 RNA是線性的聚合物，由核苷酸 (nucleotide) 組成。每個基因的訊息由不同的核苷　酸所決定，就像一個句子的意義，由26個英文字母排列順序來決定。有四個不同的核苷酸與它們的排列順序決定基因訊息 。 每一個核苷酸有三部分：磷酸根 (phosphate group)，5個碳的糖類，和一個含有氮的鹼基 (base)。磷酸根與糖類形成每一股DNA和RNA的支架。鹼基接上糖類並從旁突出。 在DNA，糖類都是去氧核糖 (deoxyribose)，在RNA，則是核糖(ribose)。兩種糖類都是五碳糖 (pentoses)。去氧核糖比核糖少一個氧。 核苷酸鏈是由磷酸根將一個在去氧核糖的5-碳與下一個核苷酸的3-位置做鍵結而成，如圖3.04。磷酸根與糖類兩端則是以磷酸酯 (ester) 的鍵結，因此也叫作磷酸雙酯 (phosphodiester) 鍵結。這個磷酸根與糖類的鍵結，帶著負電荷。 DNA 和RNA各有四個鹼基 核苷酸有五種不同的含氮鹼基，DNA的鹼基為adenine、guanine、cytosine和thymine。我們經常以A，G，C和T來表示。RNA則有著A，G和C，但T則被uracil (U) 取代。從基因訊息的觀點來看，DNA中的T和RNA中的U事實上是相同的。 在核酸上的鹼基屬於兩類，一是pyrimidines，另一purines。較小的pyrimidine鹼基包含著一個單環，而purine則有兩個環共用一個邊。Adenine 和guanine 屬於purines，而 thymine、uracil 和 cytosine則屬於pyrimidines。purine和pyrimidine的環狀系統以及它們的衍生物如圖3.05所示。 核苷是由鹼基與糖組成；核酸是由核苷加上磷酸而成 一個鹼基加上糖類就是核苷(nucleoside)。一個鹼基加上糖類與磷酸根就是核苷酸 (nucleotide)。若有必要，我們可以糖類上的去氧核糖 (deoxyribose) 來認定去氧核苷(deoxynucleoside) 或去氧核苷酸 (deoxynucleotide)。而若是有著核糖 (ribose)，則可認定為核糖核苷(ribonucleoside) 或是核糖核苷酸 (ribonucleotide)。nucleoside的命名與其相對應鹼基的命名非常類似。 兩條DNA形成雙股螺旋 核苷酸的聯結以一個的5的磷酸根鍵結到下一個3 的 －OH基上。一般來說，在核酸鏈上5 -端上有自由的磷酸根，而在3-端上有自由的 －OH基。 5-端被認為是DNA及RNA的起始端，而基因訊息的讀取以5-端開始。 一般說來，RNA是以單條分子存在，而DNA則是以雙股存在。要注意雙股螺旋這兩條DNA是反向平行 (antiparallel) 的，它們指向相反的方向。這代表一條DNA的5-端也就是另一條反向DNA的3-端。 法蘭西斯?克拉克 (Francis Crick) 和詹姆斯?華生 (James Watson) 在1953首先提出的有名雙股螺旋 (double helix)。DNA的雙股螺旋同時以鹼基間形成的氫鍵，以及雙股螺旋中心的六碳環疊在一起。 DNA形成右手螺旋 (right-handed helix)，要區分右手的雙股螺旋與左手的雙股螺旋，我們必須得從螺旋中心往下看，若為右手的雙股螺旋，每一條DNA必須是以順時鐘往遠離觀察者的方向移動。 鹼基配對的穩定利用氫鍵的形成 雙股螺旋的DNA，一條的DNA分子上的鹼基突出而向著雙股螺旋的中心，與另一條DNA分子的鹼基形成氫鍵 (hydrogen bond) 而達成配對。adenine (A) 總是與另一條DNA分子的thymine (T) 配對，而guanine (G) 總是與另一條DNA分子的cytosine (C) 配對。 在DNA鹼基對 (base pair) 上的氫鍵主要以氧或氮及其上所帶著的氫所組成，也就是以下的三種可能的排列方式：O－H－O、N－H－N和O－H－N。 每一對鹼基包含一個大的purine 鹼基與一個較小的pyrimidine鹼基配對。雖然鹼基本身大