乳腺癌差异表达的MicroRNA的筛选研究.pdfVIP

第 30卷 第 1期 中山大学学报 (医学科学版) Vo1．30 No．1 2009年 1月 JOURNALOFSUNYAT—SENUNIVERSITY(MEDICALSCIENCES) Jan． 2009 乳腺癌差异表达的MicroRNA的筛选研究 黄秀芳 l_2，邵建永 ，颜黎栩 ，李晓霞 ，杜紫明 ’，邓 玲 ，梁小曼 (1．华南肿瘤学国家重点实验室∥中山大学肿瘤防治中心病理科，广东 广州 510060； 2．江门市中心医院病理科 ．广东 江门 529030) 摘 要：【目的】应用miRNA芯片技术筛选乳腺癌及癌旁组织差异表达的miRNA，发现与乳腺癌相关的miRNA，为进 一 步阐明其在乳腺癌发病机制中的作用打下基础。 【方法】收集 8例新鲜的乳腺癌及其癌旁组织，抽提总RNA并分离出小 RNA进行 Cy3荧光标记 ，将标记的小RNA在 miRNA芯片上进行杂交反应，应用实时定量 RT—PCR方法验证miRNAs芯片结 果的可靠性。 【结果J对芯片数据进行 SAM分析，结果筛选获得 16个乳腺癌相关miRNAs，相对于癌旁组织，在乳腺癌组织 中9个 miRNAs表达上调 ，7个miRNAs表达下调。其中显著上调的有 miR一21，miR．365，显著下调的有 miR一497，miR一31。【结 论】筛选得到乳腺癌miRNA差异表达谱，其可能与乳腺癌的发生发展有关。 关键词：miRNA；乳腺癌 ；miRNA芯片；实时定量 RT—PCR 中图分类号 ：R737．9 文献标识码 ：A 文章编号：1672—3554(2009)Ol一0069—05 IdentificationofDifferentiallyExpressedM icroRNAsinBreastCancer HUANGXiu—fang，，SHAO Jian—yong， ，YAN Li—xu，LIXiao—xia，DUZi—ming，， DENG Ling，-．LIANG Xiao—man (1．StateKeyLaboratoryofOneologyinSouthernChina； 2．DepartmentofPathology，CancerCenter，SUN Yat—senUniversity，Guangzhou510060，China； 3．DepartmentofPatholoyg ，JiangmenCentralHospital，Jiangmen529030，China) Abstract： 【Objective】Toscreenandidenti~ themiRNAdifferentialexpressionprofileinbreastcancer(BRCA)by themiRNAarraytechniquetomakefurtherstudyonthefunctionofmiRNAinpathogenesisofBRCA．M【ethods】TotalRNAwas extractedfrom8breasttumorsamplesandnormaladjacenttissues．SmallmiRNAwasisolatedrfom totalRNA， labeledwithCy3 andhybridizedonmiRNAarray．RealtimequantitativePCRwasappliedtoverifythereliabilityofmiRNAarrayresults．R【esults】 Bysignificanceanalysisofmicroarrays (SAM) basedonmicroarrayscreening， 16BRCArelatedmiRNAswereobtained． In BRCA，9up—regulated and7down—regulatedmiRNAswereobserved．Themostsignificantup—regulatedmiRNAswere