五龄飞蝗不同发育时间实时定量pcr内参基因的筛选-应用昆虫学报.pdfVIP

五龄飞蝗不同发育时间实时定量pcr内参基因的筛选-应用昆虫学报.pdf

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应用昆虫学报Chinese Journal of Applied Entomology 2014, 51(3): 733−740. DOI: 10.7679/j.issn.2095−1353.2014.088 五龄飞蝗不同发育时间实时定量 PCR 内参基因的筛选* ** *** 崔 淼 刘晓健 李 涛 郭亚平 马恩波 张建珍 (山西大学应用生物学研究所 太原 030006 ) 摘 要 【目的】筛选 5 龄飞蝗不同发育时间的最适内参基因,为相关研究提供基础数据。【方法】本 文选取β-肌动蛋白(β-actin )、延长因子(EF-1α)、3-磷酸甘油醛脱氢酶(GAPDH )、核糖体蛋白49 (RP49 )、 α-微管蛋白(α-Tubulin )和18S 核糖体RNA(18S rRNA )基因作为候选内参基因,运用实时定量PCR(qPCR ) 方法研究各基因在5 龄飞蝗不同发育时间的相对表达量,用geNorm 与Normfinder 软件分析这6 个基因表 【结果】geNorm 分析结果显示6 个内参基因表达稳定度M 值顺序为:β-actin (0.3720 )>RP49 达稳定性。 (0.3750 )>α-Tubulin (0.4030 )>18S rRNA (0.4270 )>EF-1α (0.4970 )>GAPDH (0.6040 )。M 值越 小表示基因表达稳定度越高,同时geNorm 软件以标准化因子配对差异值(Pairwise variations )0.15 默认 为取舍值,由于V2/3=0.098 <0.15 ,所以最适内参基因数目为2 个。运用NormFinder 软件也得出相似的 结果。【结论】β-actin 与RP49 为5 龄飞蝗不同发育时间的最适内参基因。 关键词 飞蝗,实时定量PCR ,内参基因,geNorm ,NormFinder Selection of reference genes on different days during the development of the fifth-instar nymph of Locusta migratoria with quantitative real-time PCR ** *** CUI Miao LIU Xiao-Jian LI Tao GUO Ya-Ping MA En-Bo ZHANG Jian-Zhen (Research Institute of Applied Biology, Shanxi University, Taiyuan 030006, China) Abstract [Objectives] To identify the most appropriate reference genes on different days during the development of fifth-instar nymphs of Locusta migratoria to pave the way for relevant studies. [Methods] Six genes were selected as candidate reference genes, including the beta actin gene (

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