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生态学杂志ChineseJournal of Ecology 2016,35(4):1019 1025 DOI:10.13292/ j.1000 4890.201604.034
基于高通量测序技术分析患病与健康虾夷扇贝
(Patinopectenyessoensis)闭壳肌菌群多样性
1 1 1∗ 2 2
窦 妍 赵晓伟 丁 君 刘圣聪 张 涛
1 2
( 大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室,辽宁大连 116023; 大连天正实业有限公司,辽宁大连 116023)
摘 要 本研究取自同一养殖海域不同浮筏养殖笼中健康和患脓包病虾夷扇贝(Patino⁃
pectenyessoensis)样品,健康虾夷扇贝样品标记为CK,患病样品分别标记为S1、S2 和S3,使
用MiSeq 高通量测序技术比较不同生存状态的虾夷扇贝的微生物组成与差异。 结果表明:
4个样品中菌群多样性表现为S3>CK>S1>S2;4 个样品中的细菌可归为24 个门,主要门类
有变形菌门、拟杆菌门、浮霉菌门、梭杆菌门、厚壁菌门、酸杆菌门、放线菌门、硝化螺旋菌
门、绿菌门和绿弯菌门;在健康虾夷扇贝样品中,变形菌门占绝对优势,占整个菌群的
95.9%,患病虾夷扇贝样品中,S1和S3 中优势类群均为变形菌门,分别占整个菌群的80.4%
和86.8%,S2 中优势菌群为拟杆菌门,占56.9%。
关键词 虾夷扇贝;变形菌门;微生物多样性;高通量测序
Applicationofhigh⁃throughputsequencingforanalyzingbacterialdiversityintheadductor
1 1
muscle of sick and healthy Patinopecten yessoensis. DOU Yan , ZHAO Xiao⁃wei , DING
1∗ 2 2
Jun ,LIU Sheng⁃cong ,ZHANGTao (Key Laboratory of Mariculture &Stock Enhancement in
North China’s Sea,Ministry of Agriculture,Dalian Ocean University,Dalian 116023,Liaoning,
China;Dalian Tianzheng Industry Co.,Ltd.,Dalian 116023,Liaoning,China).
Abstract:Healthy and sick samplesofPatinopectenyessoensis weretakenfromdifferent culturing
cages. The healthy sampleswere tagged as CK and the sickness samples were tagged as S1,S2
and S3 respectively. Using MiSeq sequencing method,we compared the microbial structure and
variat
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