个巴西橡胶树钙调素基因假基因的识别-维普.pdfVIP

维普资讯 云 南 植 物 研 究 2008。30 (3)：340 344 AetaBotanieaYunnaniea DOI：10．3724／sP．J．1143．2008．07203 一 个 巴西橡胶树钙调素基因假基因的识别 张治礼 ，苏火生 ，李维国。 (1中国热带农业科学院热带生物技术研究所，海南 海El571101；2海南省农业科学院，海南海El 571100； 3中国热带农业科学院橡胶研究所，海南 儋州 571737) 摘要：以巴西橡胶树 (Heveabrasiliensis)基因组 DNA为模板，根据胶乳钙调素基因HbCaM序列设计引物 ， 利用 PCR方法克隆获得了1319bp和 447bp的两个 DNA片段。序列分析表明，1319bp的DNA长片段为胶 乳钙调素基 因册 的DNA片段 ，含有两个外显子 (77bp和373bp)和 1个内含子 (869bp)，包含了 HbCaMcDNA编码区447bp的全部序列；447bp的DNA小片段与 册 cDNA核苷酸序列同源性高达 98％，ORF分析发现，位于406bp处的碱基c突变为T，即三联体密码CAG突变为终止子TAG使翻译提前 终止，其余5个差异碱基都不影响或改变正常的翻译。推测此447bp的DNA片段为巴西橡胶树钙调素 m． CaM 基因的假基因，命名为 HbCaMP1。 关键词：巴西橡胶树；钙凋素基因；假基因 中图分类号 ：Q753 文献标识码：A 文章编号 ：0253—2700(2008)03—340—05 IdentificationofaPseudogeneofCalmodulinGene inHeveabrasiliensis(Euphorbiaceae) ZHANG Zhi—U ，SU Huo—Sheng ，LIWei—Guo3 (1InstituteofTropicalBioscienceandBiotechnology，ChineseAcademyofTrop／calAgr／calutralSce／nces，Haikou571101，China； 2Ha／nanAcadmrryofAgr／calturalSce／nces，Haikou571101，hCina；3RubberResearch Insttiute． ChineseAcademyofTropicalAgriculturalSc／ences，Dan~ou571737，China) Ah曲 ct：Employingapairofprimersdesignedfrom cDNAofaHbCaM gene，two1371bpand44 7br,-le,~hfragments wereisolatde from genomeDNA inHeveabrasillemis．sequenceanalysisshowde thatthelongerfragmentwastheHbCaM genewith2exons(including the77bpand373bp-lengthfragments)nadall869bp-lengthintron，andhteshorterfragment had98％ identitywiht cDNA sequenceofHbCaM gene．Como,~ tocDNA ofhteHbCaM gene，6mutatde nucleotides wereidentifide inhte447bp-lengthfragment，inwhichTmuattde from Cat4O6bpsitelde tohteoceun~neeofstopcodon TAG inadvnace．The447bp-lengthfragmentwasherebysugges