154个有机化合物X射线粉末衍射实验谱图和计算谱图的比较.pdfVIP

154个有机化合物X射线粉末衍射实验谱图和计算谱图的比较 姚心侃1，杨春元2，李勇2，杨莹2，郝建民3 1．南开大学中心实验室， 天津， 300071 57 2．国家纳米技术与工程研究院， 天津，3004 3．信息产业部电子第46研究所，天津55信箱，300192 1． 前 言 DataCentre，CCDC)的剑桥结 剑桥晶体学数据中心(CambridgeCrystallographic Structural 构数据库(Cambridge 或中子衍射测定了三维晶体结构数据的30万种有机化合物的结构信息，包括了普通有机化 合物，金属有机化合物和金属配位化合物三大类。该中心己同意国际衍射数据中心 (InternationalCenterforDiffractionData，ICDD)把这些晶体结构数据转换为粉末 衍射计算数据和图谱，并列入ICDD的“粉末衍射文件(PowderDiffractionFile，PDF)”， C”。 ICDD对这样的数据给以标记“Quality 由三维晶体结构数据计算得到的X射线粉末衍射计算谱图与使用X射线粉末衍射仪实测 得到的实验谱图，这两者是否有差别?有哪些差别?本文用我们自己实验室完成的154个有 机化合物的X射线粉末衍射实验谱图和计算谱图进行了比较。观察和分析了这个问题。并指 出，这对于有机化合物的物相鉴定，对于有机化合物粉末衍射数据的指标化，对于利用有机 化合物的粉末衍射数据从头解结构，能够有些什么启发和帮助。 2． 实 验 2．1化合物 本文所取的154个化合物分别属于普通有机化合物，金属有机化合物和金属配位化合物 这二大类。这些化合物的分子中碳原子个数最少的是C6H6F30，即， H2N O—CH广CF3 而分子中碳原子个数最多的是 4-(2，2，2-Trifluoroethoxy)pyrimidin-2一ylamine。 C92HiosFe40ioSn4·2(C6H6)，即， ．387． 化合物都已经培养为适合x射线单晶衍射分析的单晶体。这154个化合物中，晶胞体积最 A3。所以，这154个化合物从品种和 小的小到了348．2A3，而晶胞体积最大则达到了8195 ● 大小方面都可以认为有较好的代表性。 2．2实验条件 用BrukerSMART1000型单晶衍射仪进行这些化合物的单晶衍射数据收集和结构测定， 并得到它们的粉末衍射计算谱图¨1。仪器使用的设定参数是： 50kVx30mA，MoKa，1000 型CCD检测器。单晶实验完成后，把这些化合物的单晶体研磨成粉末作为粉末衍射实验样 品，用Rigaku的DMAX-RC型多晶衍射仪得到它们的粉末衍射的实验谱图。仪器使用的设定 参数是：50kVxl80mA，CuKQ，固定散射狭缝(DS)为0．50，固定接收狭缝(RS)为0．15ram， 步进扫描，步长O．Qlo，5秒／每步。Si粉内标以消除系统误差，样品压紧在一个自制的低背 景单晶硅样品架内，没有消除择优取向的措施。使用NBS*AIDS83程序啦!得到其最终的晶胞 参数。 3．结果和讨论 将实验谱图与计算谱图比较，发现有下列值得注意之处。 3．1杂质问题 有些实验谱图存在明显“多余的”衍射峰，只能认为是属于杂质峰。杂质来源：样品不 稳定，几天时间就可能有分解；研磨可能造成样品局部分解：尤其值得注意的是，部分单晶 颗粒上本来就附着有杂质(一些单品质量不佳的样品固然如此，一些看起来单晶质量尚可的 样品也发生这种情况)。从杂质峰的强度估计，杂质含量常常远大