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第 35卷 第6期 广东海洋大学学报 Vbl-35NO．6
2015年 12月 JournalofGuangdongOceanUniversity Dec．2015
doi：10．3969~．issn．16739·159．2015．06．00l
稀杯盔形珊瑚转录组分析
刘金豆，刘 丽，黄元佳
(广东海洋大学水产学院／，南海水产经济动物增养殖广东省普通高校重点实验室／／
南海生物资源开发与利用协同创新中心 广东 湛江 524088)
摘 要：以高通量测序技术llluminaHiSeqM2000对稀杯盔形珊瑚 (Galaxeaastreata)进行转录组测序分析，
共获得短序列 (reads)。利用 Trinity软件对所有 reads从头组装后得到 81014条单基因簇
(Unigenes)，60471条(74．58％)编码蛋白框(CodingSequences，CDs)。与Nr(Non—redundant，非冗余)、COG(Cluster
ofOrthologousGroupsofproteins，蛋白相邻类的聚簇 )、KEGG (Kyotoencyclopediaofgenesandgenomes，京
都基因与基因组百科全书)、Swissprot四大数据库比对共获得 36545条注释基因。其中与COG数据库比对获
得 14491条注释基因，分为 24个功能类别 ，其中参与一般功能预测类的Unigene数最多，有 4642条；KEGG
分析比对获得 16021条注释基因，分成 241类 ，包括代谢通路、钙离子信号通路、MAPK信号通路等，在所有
通路中参与代谢途径的基因数最多，共有2450条(15．29％)；GO(GeneOntology,基因本体)功能分类将Unigene
分为 47个类别。
关键词：转录组；稀杯盔形珊瑚；Unigene；信号通路
中图分类号：$917．4 文献标志码 ：A 文章编号：1673．9159(2015)06．0001．08
TranscriptomeAnalysisofGalaxeaastreata
LIU Jin—Dou，LIU Li，HUANG Yuan—Jia
(FisheriesCollege，GuangdongOceanUniversity／K／eyLaboratoryofAquacultureinSouthChinaSea
forAquaticEconomicAnimalofGuangdongHigherEducationInstitutes／／SouthChinaSea
Bio-ResourceExploitationAndUtilizationCollaborativeInnovationCenter，Zhanjiang524088，China)
Abstract：High-throughputsequencingtechnologyIlluminaHiSeq 2000wasusedtosequencethe
Galaxeaastreatatranscriptome，aneadsweregotinal1．Andthenassembledsoftware
Trinity wasused to denovo assembled thereads，getting 81014 Unigenesand 60 471Coding
Sequences(CDs)．BlastedwiththefourdatabaseNr(Non—redundant)，COG(ClusterofOrthologous
Groupsofproteins)，KEGG(Kyotoencyclopediaofgenesandgenomes)，Swissprot
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