藜麦est-ssr的开发及通用性分析-作物学报-中国作物学会.pdfVIP

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2017-11-15 发布于天津
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藜麦est-ssr的开发及通用性分析-作物学报-中国作物学会

作物学报 ACTA AGRONOMICA SINICA 2016, 42(4): 492500 / ISSN 0496-3490; CODEN TSHPA9 E-mail: xbzw@ DOI: 10.3724/SP.J.1006.2016.00492 藜麦EST-SSR 的开发及通用性分析张体付1,** 戚维聪1,** 顾闽峰2 张晓林1 李坦1 赵涵1,* 1 / , 210014; 2 , 224336 : , SSR NCBI RNA RNA-Seq EST EST-SSR, 1862 EST-SSR , (38.3%), (11.7%)SSR 119 EST-SSR , 66 (55.9%), 39 4 , t , EST-SSR , , : ; EST-SSR; ; ; Exploration and Transferability Evaluation of EST-SSRs in Quinoa 1,** 1,** 2 1 1 1,* ZHANG Ti-Fu , QI Wi-Cong , GU Min-Feng , ZHANG Xiao-Lin , LI Tan , and ZHAO Han 1 Provincial Key Laboratory of Agrobiology, Jiangsu Academy of Agricultural Sciences, Nanjing 210014, China; 2 Xinyang Agricultural Experiment Station of Yancheng City, Yancheng 224336, China Abstract: Quinoa draws more and more attentions from people, since quinoa seed as grain has comprehensive nutrients. But the fundamental research on quinoa just starts and remains in a moderated level. Simple sequence repeat (SSR) development in qui- noa will enhance the resource for its genetic analysis. Here, the available RNA based sequencing (RNA-Seq) and expressed se- quence tag (EST) data of quinoa deposited in the National Center for Biotechnology Information (NCBI) were engaged in EST-SSR development. Totally, 1862 non-mononucleotide EST-SSRs were identified. Among the EST-SSRs, the dinucleotide t