轴突蛋白NRXN1基因单核苷酸多态性与汉族儿童孤独症的关联.docVIP

轴突蛋白轴突蛋白rs1363032、rs1421589、rs1563018、rs1851013、rs1520439和rs6712423）作为分子标记，运用基质辅助激光解吸电离时间飞行质谱方法对229例孤独症儿童和191例无精神神经疾病的正常对照儿童进行SNP基因分型，进行单个SNP和单倍型的病例-对照相关分析。 结果：单个SNP及单倍型分析一致显示NRXN1基因中的一个内含子SNP rs1421589与女性孤独症存在关联，其等位基因频率在女性孤独症和正常对照组之间存在显著性差异（P=0.038），T等位基因可以增加女性患孤独症的危险（OR=1.955，95% CI：1.035-3.69），且在显性和加性遗传模式下，其基因型分布也与女性孤独症存在显著性相关（显性模式：P=0.024，OR：2.86，95%CI：1.12-7.33；超显性模式：P=0.023，OR：2.2，95%CI：1.09-4.74）。1.029-3.604）。 结论： NRXN1基因一个常见变异可能与女性孤独症存在相关性，提示NRXN1基因可能是中国汉族儿童孤独症的易感基因。 关键词：孤独症；轴突蛋白轴突蛋白[1]，临床表现和严重程度不一，迄今发病机制尚不明确，但研究显示遗传因素在孤独症的发病中起主要作用，具有遗传异质性，并且提出神经生物学假说参与孤独症的病理发病机制，认为孤独症为神经发育障碍性疾病[2]，而突触发育障碍是其中一个重要组成部分，推测突触结构异常或功能失衡会造成脑功能紊乱，导致孤独症发生。因此近十年来突触相关基因，特别是NRXNs-NLGNs-SHANK3通路和孤独症相关性的研究成为新的热点[3, 4]，其中轴突蛋白NRXN1被认为是孤独症的功能候选基因。 已有多个研究发现在孤独症患者中存在包含NRXN基因的染色体异常和NRXN1基因异常，因此认为NRXN1基因可能与孤独症有关。Szatmari 等[5] 通过家系传递不平衡关联分析NRXN1基因的基因单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP）进行，发现两个SNP 位点rs1363036和rs930752在孤独症中有过度传递现象（p＜0.05），NRXN1基因单核苷酸多态性与孤独症有关联。但目前尚未见有关NRXN1基因单核苷酸多态性与中国汉族儿童孤独症发生的相关性报道，轴突蛋白探讨NRXN1单核苷酸多态性与中国汉族儿童患孤独症风险的关系孤独症为来本院门诊就诊的孤独症患者和部分孤独症培训中心的孤独症患者，孤独症ICD-10）和精神疾病诊断和统计手册（DSM-IV）。正常对照组191例，为来我院门诊体检的无遗传性疾病、无神经精神性疾病的正常儿童2.0ml注入EDTA抗凝管，轻轻震荡混匀后于4℃冰箱隔夜静置。 1.2.2 基因组DNA的提取：采用AxyPrep血基因组DNA小量试剂盒抽提样本基因组DNA，并于-80℃保存备用。 1.2.3 SNPs位点的选择和基因分型：利用生物信息数据库（/snp/），使用SNPbrowser软件以pair-wise r2法来选取标签SNP（参数：r2≥0.8；最小等位基因频率MAF≥5%），再从中选取最优的6个SNPs位点作为分子标记。 1.2.4 基因分型：运用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（Matrix-Assisted Laser Desorption/ Ionization Time of Flight Mass SpectrometryMALDI-TOF MS）χ2检验SNP的Hardy-Weinberg遗传平衡（HWE），采用Haploview 4.2软件进行等位基因频率与孤独症的相关分析，采用在线软件SNPstats分析在五种不同的遗传模式下（）Odds Ratio, OR）95%可信区间（Confidence Intervals95%CIs）SNPs间的连锁不平衡（LD）程度用参数D’和r2表示，并确定单倍型域及分析不同单倍型与孤独症的相关性，再按性别分组进行相关分析。统计分析显著性差异的P值水平为0.05。 2. 结果： 2.1 Hardy-Weinberg平衡检验 SNP位点rs6712423基因型频率分布偏离（P0.05），在后续分析中我们将这个位点排除在外。其余个SNPs位点基因型分布均符合，进入下一步的分析。等位基因频率的病例-对照关联分析 上述符合个SNPsP 0.05），再进一步按性别分组进行相关分析，结果显示rs1421589（P=0.038）其T等位基因可以增加女性患孤独症的危险（OR=1.955，95%CI：1.035-3.69），未发现其余个SNPs。结果见表1.。表1.NRXN1基因SNPs位点等位基因频率病例-对照关联分析SNP Allele Total samp