拟南芥trihelix转录因子基因家族研究-江苏科技大学学报.pdfVIP

第３１卷第２期 江苏科技大学学报（自然科学版） Ｖｏｌ３１ Ｎｏ２ 　 ２０１７年４月 ＪｏｕｒｎａｌｏｆＪｉａｎｇｓｕＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙｏｆＳｃｉｅｎｃｅａｎｄＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙ（ＮａｔｕｒａｌＳｃｉｅｎｃｅＥｄｉｔｉｏｎ）　 Ａｐｒ．２０１７ 　　　　　　 ｄｏｉ：１０．３９６９／ｊ．ｉｓｓｎ．１６７３－４８０７．２０１７．０２．０２０ 拟南芥 Ｔｒｉｈｅｌｉｘ转录因子基因家族研究 周　宏，钱　娇，李荣芳，陈丹丹，方荣俊，赵卫国 （江苏科技大学 生物技术学院，镇江２１２０１８） 摘　要：Ｔｒｉｈｅｌｉｘ转录因子家族在植物生长发育与响应逆境胁迫等方面发挥着重要作用，但目前基于拟南芥全基因组水平 鉴定和分析该基因家族的研究尚未见相关报道．利用生物信息学方法在拟南芥基因组数据库中鉴定到Ｔｒｉｈｅｌｉｘ家族成员３４ 个．通过序列聚类和功能结构域分析发现，该家族均含有高度保守的、特征性的Ｔｒｉｈｅｌｉｘ结构域；根据亲缘关系远近和结构 域特点，将拟南芥Ｔｒｉｈｅｌｉｘ转录因子家族分为５个亚家族，基于ＭＥＭＥ程序分析的保守基序与聚类分析结果具有较高的一 致性．采用ＩｎｔＡｃｔ在线数据库分析，发现拟南芥Ｔｒｉｈｅｌｉｘ转录因子家族各成员与其他蛋白存在互作关系．文中初步明确了拟 南芥Ｔｒｉｈｅｌｉｘ转录因子家族成员的结构和功能特点、染色体分布、核定位信号及该家族蛋白与其他蛋白质的互作情况，为进 一步揭示Ｔｒｉｈｅｌｉｘ转录因子家族的系统发育和生物学功能奠定了基础． 关键词：拟南芥；Ｔｒｉｈｅｌｉｘ；转录因子家族；进化 中图分类号：Ｑ７１；Ｑ８１１４　　　　　文献标志码：Ａ　　　　　文章编号：１６７３－４８０７（２０１７）０２－０２３１－０６ ＲｅｓｅａｒｃｈｏｆｔｈｅＡｒａｂｉｄｏｐｓｉｓＴｒｉｈｅｌｉｘｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎｆａｃｔｏｒｇｅｎｅｆａｍｉｌｙ ＺＨＯＵＨｏｎｇ，ＱＩＡＮＪｉａｏ，ＬＩＲｏｎｇｆａｎｇ，ＣＨＥＮＤａｎｄａｎ，ＦＡＮＧＲｏｎｇｊｕｎ，ＺＨＡＯＷｅｉｇｕｏ （ＣｏｌｌｅｇｅｏｆＢｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，ＪｉａｎｇｓｕＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙｏｆＳｃｉｅｎｃｅａｎｄＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｚｈｅｎｊｉａｎｇ２１２０１８，Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｔｒｉｈｅｌｉｘｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎｆａｃｔｏｒｆａｍｉｌｙｐｌａｙｓａｎｅｓｓｅｎｔｉａｌｒｏｌｅｉｎｐｌａｎｔｇｒｏｗｔｈ，ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔａｎｄｓｔｒｅｓｓｒｅ ｓｐｏｎｓｅ；Ｈｏｗｅｖｅｒ，ｆｅｗｓｔｕｄｉｅｓａｂｏｕｔｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎａｎｄａｎａｌｙｓｉｓｏｆｔｈｉｓｇｅｎｅｆａｍｉｌｙｉｎＡｒａｂｉｄｏｐｓｉｓｏｎｔｈｅｇｅｎｏｍｅ ｗｉｄｅｌｅｖｅｌｈａｖｂｅｅｎｒｅｐｏｒｔｅｄ．Ｉｎｔｈｉｓｓｔｕｄｙ，３４ｍｅｍｂｅｒｓｏｆＴｒｉｈｅｌｉｘｆａｍｉｌｙ，ｗｈｉｃｈｃｏｎｔａｉｎｈｉｇｈｌｙｃｏｎｓｅｒｖｅｄａｎｄ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃＴｒｉｈｅｌｉｘｄｏｍａｉｎｔｈｒｏｕｇｈｓｅｑｕｅｎｃｅｃｌｕｓｔｅｒｉｎｇａｎｄｆｕｎｃｔｉｏｎａｌｄｏｍａｉｎｓａｎａｌｙｓｉｓ，ｗｅｒｅｉｄｅｎｔｉｆｉｅｄｉｎＡｒ ａｂｉｄｏｐｓｉｓｇｅｎｏｍｅｄａｔａｂａｓｅｕｓｉｎｇｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｔｏｏｌｓ．Ｔｈｅｓｅｍｅｍｂｅｒｓｃｏｕｌｄｂｅｃｌａｓｓｉｆｉｅｄｉｎｔｏ５ｓｕｂｆａｍｉｌｉｅｓｂａｓｅｄ ｏｎｔｈｅｅｖｏｌｕｔｉｏｎａｒｙｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐａｎｄｄｏｍａｉｎｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ．ＴｈｅｃｏｎｓｅｒｖｅｄｍｏｔｉｆｓｉｎＴｒｉｈｅｌｉｘｆａｍｉｌｙｏｆＡｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ ａｎａｌｙｚｅｄｕｓｉｎｇｔｈｅＭＥＭＥｐｒｏｇｒａｍｗａｓｈｉｇｈｌｙｃｏｎｓｉｓｔｅｎｔｗｉｔｈｔｈｅｒｅｓｕｌｔｓｏｆｃｌｕｓｔｅｒｉｎｇａｎａｌｙｓｅｓ．Ｎｉｎｅｍｅｍｂｅｒｓｏｆ ＴｒｉｈｅｌｉｘｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎｆａｃｔｏｒｆａｍｉｌｙｗｅｒｅｆｏｕｎｄｔｏｉｎｔｅｒａｃｔｗｉｔｈｏｔｈｅｒｐｒｏｔｅｉｎｓｉｎＡｒａｂｉｄｏｐｓｉｓｕｓｉｎｇＩｎｔＡｃｔｏｎｌｉｎｅｄａ ｔａｂａｓｅａｎａｌｙｓｉｓ．Ｏｕｒｒｅｓｕｌｔｓｐｒｅｌｉｍｉｎａｒｉｌｙｉｄｅｎｔｉｆｉｅｄｔｈｅｅｖｏｌｕｔｉｏｎ，ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅｄｉｓｔｒｉｂ