拟南芥转酮醇酶蛋白attkl1的同源建模及与琢鄄三联噻吩结合作用分析.pdfVIP

Vol.36 高等 学校 化 学 学报 No.4 2015年4 月 摇 摇 摇 摇 摇 摇 CHEMICALJOURNAL OF CHINESE UNIVERSITIES摇 摇 摇 摇 摇 摇 682~686 doi:10.7503/ cjc 摇 摇 拟拟南芥转酮醇酶蛋白AtTKL1 的同源建模 及与琢鄄三联噻吩结合作用分析 1,2 1 2 1 1,2 2 赵摇 斌 ,霍静倩 ,邢继红 ,齐摇 萌 ,张金林 ,董金皋 (1. 河北农业大学植物保护学院,2. 真菌毒素与植物分子病理学实验室,保定071000) 摘要摇 以玉米转酮醇酶(1ITZ)的晶体结构为模板,对拟南芥转酮醇酶(AtTKL1)的三维结构进行模拟和优 化. 利用生物信息学方法,确定其氨基酸结合位点为 His143,Gly234,Asn263,Arg434,Ser461,Gln488, Phe515,His539,Asp547 和Arg598,催化氨基酸位点为His103 和His340. 通过分子模拟确定琢鄄三联噻吩与 AtTKL1的活性口袋可有效结合,且AtTKL1的催化位点和结合位点为其与琢鄄三联噻吩结合的关键位点. 利 用荧光猝灭光谱技术确定AtTKL1与琢鄄三联噻吩之间存在结合作用;酶活力检测结果表明加入琢鄄三联噻吩 后转酮醇酶蛋白的活性降低,进一步验证了AtTKL1与琢鄄三联噻吩之间的相互作用. 关键词摇 转酮醇酶;琢鄄三联噻吩;同源建模;分子对接 中图分类号摇 O629郾7摇 摇 摇 摇 文献标志码摇 A 转酮醇酶(TKL)是植物碳代谢过程中的一个关键酶,在植物光合作用的卡尔文循环中起核心作 [1,2] 用 ,主要催化三磷酸甘油醛和六磷酸果糖反应产生五磷酸木糖和四磷酸赤癣糖,促进三磷酸甘油 [3,4] 醛和七磷酸景天庚酮糖转变为五磷酸木糖和四磷酸赤癣糖 . TKL首先在酿酒酵母中被发现,随后 [5] [6] [7] 在细菌 、植物 和动物 中被证实存在. 研究人员开展了对该基因在生理和代谢等方面的研究以及 体内定位研究,发现TKL位于植物进行光合作用的叶绿体内或不进行光合作用的质体内,成熟的TKL [4] 结合在植物叶绿体的内囊体膜上,从而参与光合作用中碳的固定,在卡尔文循环中起着重要作用 . 这些反应的直接底物和产物均为核酸、芳香族氨基酸和维生素等的合成前体. TKL是植物光合速率的 限速酶,其活性微弱的下降即可导致植物生长速度降低,使苯丙氨酸和芳香族氨基酸代谢受到抑 [8,9] 制 . 由于TKL在植物光合作用中起关键作用,且各种植物的TKL蛋白序列和功能都高度同源,因 [8] 而其研究对于提高植物光合利用效率以及研究新型除草剂均有重要意义. Henkes等 发现,转酮醇酶 可作为除草剂作用靶标来开发新型除草剂. 在拟南芥体内存在2种转酮醇酶AtTKL1和AtTKL2,其中 [10] [11] AtTKL1发挥主要作用 . 琢鄄三联噻吩(CAS:1081鄄34鄄1)是聚噻吩的单体前体,前文 从外来入侵植 物黄顶菊中提取得到琢鄄三联噻吩,并证实其可以作为除草剂使用,对马唐和狗尾草等杂草具有较强的 [12] 抑制作