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第十五章 RNA的剪接加工 基本概念 多数新转录的RNA分子(初级转录子)都需经过不同的改变才能成为成熟的RNA,此过程称为RNA加工(RNA processing) 最常见的RNA加工方式包括: 利用核酸内切或外切酶进行的核苷酸去除 向初级转录子或其裂解产物末端添加核苷酸 某些核苷酸的化学修饰 一、原核rRNA的加工 大肠杆菌基因组共有7个散在的rRNA操纵子,每一操纵子含各有一个拷贝的5S、16S和23S rRNA序列,在tRNA编码序列之间也存在rRNA操纵子 至少有7种RNA酶(RNAase)参与前体rRNA的加工 二、真核rRNA的加工 许多真核细胞的rRNA基因以串联重复的基因丛方式存在,每基因丛的转录单元拷贝数100个,由RNA聚合酶I负责转录 真核rRNA加工的具体步骤不很清楚,前rRNA分别各含1个拷贝的18S、5.8S和28S编码区 真核细胞的5S rRNA由RNA Pol III从非连锁基因转录产生 三、原核细胞的核糖体 核糖体分别占据大肠杆菌干物质的25%、总蛋白的10%和总RNA的80%,可见核糖体对细胞的重要性 70S的核糖体包括1个50S和1个30S亚单位 50S包括1个23S rRNA、1个5S rRNA 和31个蛋白质分子 30S亚单位包括1个16S rRNA和21个蛋白质分子 四、 真核细胞的核糖体 80S核糖体由1个60S亚基和1个40S亚基组成 60S亚基包含约45种蛋白、1个5S rRNA分子、1个5.8 S rRNA及1个28S rRNA分子 40S亚基包含18S rRNA和约30种蛋白 第二节tRNA的加工 原核生物和真核生物刚转录生成的tRNA前体一般无生物活性,需要进行以下步骤: ①剪切和拼接; ②碱基修饰; ③3-OH连接-ACC结构 第三节mRNA的加工 一、原核mRNA的加工 原核mRNA转录子一般不需要加工,在其合成尚未完成之前,核糖体即开始装配和蛋白质转译 原核mRNA的降解速度很快,转录子的转译时间非常有限,但若5-或3-端有干-环结构保护,转录的时间则相对较长 二、真核mRNA的加工修饰 所有真核蛋白编码基因都由RNA聚合酶 II负责转录,转录子的长度差异很大,统称为异源核RNA(heterogeneous nuclear RNA, hnRNA) 其中能被加工成mRNA的转录子叫做前mRNA(pre-mRNA) 加工过程包括5?-帽形成、3?-多聚腺苷酸化、内含子剪接和碱基修饰 前mRNA合成后很快被蛋白质包裹成异源核蛋白体(hnRNP),参与包裹的蛋白质分别被命名为hnRNP 蛋白A-U 从细胞核提纯的包裹蛋白为相当均质的颗粒,称为hnRNP颗粒 hnRNP使hnRNA保持单链形式,协助RNA加工 (一)5?端加帽 在前mRNA链长度达25-30nt前,其5?-端以添加7-甲基鸟苷(m7G)方式进行化学修饰,这种5?-结构称为5?-帽 加帽反应由鸟苷转移酶催化,随后在第一和第二个核苷酸上可能发生的糖基甲基化,特别是脊椎动物 帽结构对转录子具有稳定作用,对RNA剪接、核运输和转译等过程也具有重要作用 (二)3?端多聚腺苷酸化 绝大多数真核mRNA的成熟3?-端都发生多聚腺苷酸化,即添加一串A碱基,也称3?-端加尾 加尾部位由特定的序列决定,包括5-AAUAAA-3(多聚腺苷酸化信号)、5-YA-3(Y代表嘧啶)序列和下游的GU富含序列,统称为多聚腺苷酸化部位 反应需要许多蛋白因子的参与,先在特定部位发生裂解反应,然后由poly(A)聚合酶将约250个A碱基加到裂解产物的3’-端 poly(A)尾有助于mRNA分子的稳定和成熟mRNA的转译 在分子生物学实验中,poly(A)尾为mRNA的分离提取、cDNA合成和RT-PCR检测提供了很大方便 (三)RNA剪接 RNA剪接(splicing):指真核细胞将前mRNA中的内含子切除,并将外显子拼接的过程,反应在细胞核内进行,产生的成熟mRNA转运到细胞浆进行转译 剪接部位由特定序列决定,几乎所有内含子的5 ? -端为GU(剪接供体部位),3?-端为AG(剪接受体部位),其他序列有富含嘧啶碱基的多嘧啶轨和分支点 剪接反应分两步进行,第一步裂解反应发生在5?-剪接部位,第二步裂解发生在3-剪接部位,当两个外显子被连接在一起后,内含子以套索形式释放降解 (四)mRNA的可变(选择性)剪接 定义:通过不同的剪接方式从一个mRNA前体产生不同的mRNA的过程,是调节基因表达和产生蛋白质组多样性的重要机制,受多种顺式作用序列和反式作用因子相互作用调节 分类: 选择性利用启动子 选择性利用poly(A)部位 选择性保留内含子 选择性利用外显子 * 第一节核糖体RNA (rRNA)的加工 31种
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