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酵母双杂交整理
酵母双杂交技术检测相互作用的蛋白质 1. 基本原理 2. 功能应用 3. 基本流程 4. 发展延伸 基本原理 真核生物中都含有反式作用因子和顺式作用元件,调节基因的表达。 不同来源激活因子的BD区与AD结合后则特异地激活被BD结合的基因表达。 酵母双杂交系统由三个部分组成 目前酵母双杂交实验采用的有LexA 系统和Gal4 系统两种。 LexA系统:DNA 结合结构域由一个完整的原核蛋白LexA 构成,转录活化结构域则是大肠杆菌多肽B42 构成。 Gal4 系统中: BD 和AD 分别由Gal4蛋白上不同的两个结构域构成。 系统优点 是在真核酵母细胞内进行,蛋白质有可能保持天然的折叠状态。 双杂交系统的敏感度高。 在筛选cDNA 文库时,双杂交系统能够简捷地得到编码相互作用蛋白的基因序列。 系统局限性 1.假阳性问题 2.假阴性问题 3.转化效率偏低 功能应用 检验一对功能已知蛋白间的相互作用。 研究一对蛋白间发生相互作用所必需的结域。 用已知功能的蛋白基因筛选双杂交cDNA文库 分析新基因的生物学功能。 酵母双杂交系统的组成 1. 载体质粒: pLexA、pB42AD、p8op-LacZ、pB42AD-DNA文库 2. 酵母菌株: EGY48、EGY48(p8op-LacZ)、YM42 3. 大肠杆菌菌株:E.coli KC8株 4. 对照质粒: pLexA-53,pB42AD-T 阳性对照 pLexA-Pos (LexA/GAL4 AD融合蛋白〕 阳性对照 pLexA-Lam (LaminC蛋白少与其它蛋白相互作用) 假阳性 检测质粒 5. 引物:pLexA测序引物及pB42AD测序引物。 筛选标志 1.质粒p8op-LacZ因筛选标志为URA3 2.质粒pLexA的筛选标志为HIS3 3.质粒pB42AD的筛选标志为TRP1 基本流程 将报告基因p8op-LacZ转化酵母EGY48菌株,用培养基SD/-Ura筛选。 同时构建或扩增DNA文库。 构建DNA-BD/靶蛋白质粒pLexA-X,作为钓饵。 将上述钓饵质粒pLexA-X转化EGY48(p8op-LacZ)细胞株,用SD/-His/-Ura筛选;并用固体诱导培养基SD/Gal/Raf/-His/-Ura检测此DNA-BD/靶蛋白是否具有直接激活报告基因的活性,以及对酵母细胞是否具有杀伤毒性。 转化质粒 选择培养基 克隆生长情况 说 明(含有Gal/Raf)? ? pLexA-Pos SD/-His, -Ura 蓝 阳性对照 pLexA SD/-His,-Ura 白 阴性对照 PlexA-X SD/-His,-Ura 白 没有直接活 PlexA-X SD/-His,-Ura 蓝 具有直接激活 PlexA-X SD/-His,-Ura 菌落不能生长 酵母细胞毒性 5检测质粒转化效率。 转 化 质 粒 SD固体培养基 LacZ表型 对照1 pLexA-Pos Gal/Raf/-His/-Ura 蓝 对照2 pLexA-53 Gal/Raf/-His/-Trp/-Ura/-Leu 蓝 +pB42AD-T ? ? 实 验 pLexA-X Gal/Raf/-His/-Trp/-Ura/-Leu 待测 +pB42AD-文库? ? 5.1 用SD/-His/-Trp/-Ura培养基选择阳性共转化子,并扩增. 5.2 上述重组子转至含X-gal的固体诱导培养基SD/Gal/Raf/-His/-Trp/-Ura/-Leu,观察LacZ及Leu报告基因的表达情形. 5.3 将蓝色阳性克隆进行1次以
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