分析我院消化科幽门螺杆菌左氧氟沙星耐药与gyrA基因突变关系.docVIP

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分析我院消化科幽门螺杆菌左氧氟沙星耐药与gyrA基因突变关系

精品论文 参考文献 分析我院消化科幽门螺杆菌左氧氟沙星耐药与gyrA基因突变关系 洪鉴光   【摘 要】 目的 分析幽门螺杆菌(Hp)对左氧氟沙星耐药性及左氧氟沙星耐药菌株与敏感菌株间gyrA基因的DNA序列差异,探索gyrA基因突变在Hp左氧氟沙星耐药产生过程中的作用。方法 我院消化科2011年2月至2013年2月进行胃镜检查的慢性胃炎、消化性溃疡的患者,将胃镜活黏膜标本接种于Hp选择性培养基,37℃微需氧环境培养3-5d,分离Hp菌株,采用氧化酶试验、过氧化氢酶试验、尿素酶试验和UreA基因PCR扩增鉴定菌种。左氧氟沙星药敏试验采用E-test法,筛选出耐药菌株和敏感菌株。提取Hp菌株基因组DNA,PCR扩增gyrA基因并进行测序并分析。结果 38例临床分离Hp菌株通过左氧氟沙星E-test药敏试验,其中12例最低抑菌浓度(MIC)>1.0ug/ml,耐药菌株占31.58%,敏感菌株占68.42%。gyrA基因测序结果显示,261、271和272位点在10例耐药菌株存在突变;C261A突变2例,C261G突变1例,G271A突变2例,A272G突变2例,C261A与G271T、A272G突变2例,G271A与A272G突变1例,而在26株敏感菌株未发现突变。结论 我院消化科分离Hp的临床菌株左氧氟沙星耐药率较高,其耐药与gyrA基因261、271和272位点有关。   【关键词】 幽门螺杆菌; 左氧氟沙星; 敏感菌株间gyrA基因; DNA序列差异   幽门螺杆菌(Helicobacter pyroli,Hp)感染是慢性胃炎和消化性溃疡的主要病因,与胃黏膜相关淋巴样组织(MALT)淋巴瘤等多种消化系统疾病具有密切的关系,已被世界卫生组织列入I类致癌原[1]。而Hp的耐药性是导致Hp根除失败的重要原因,所以Hp感染的治疗是Hp研究领域中的核心问题。目前常用的抗生素如甲硝唑、阿莫西林、克拉霉素都存在不同程度的耐药问题,耐药率有不断增加趋势[2]。近年来国内外Hp共识意见新推荐左氧氟沙星作为Hp根除药物,左氧氟沙星是一种新型的氟喹喏酮类抗生素,抗菌谱广、疗效高、不良反应少[3-4]。本研究采用E—test方法分析Hp在我院消化科收治病人的左氧氟沙星耐药特征,并测序分析了gyrA基因突变与左氧氟沙星耐药的关系。   材料与方法   1.实验菌株:38株Hp分离菌株来自我院消化科2011年2月至2013年2月进行胃镜检查的???性胃炎、消化性溃疡的患者,检查前1个月内未服用抗Hp药物。   2.细菌培养:采用匀浆接种法接种。用高压灭菌过的滴管吸取标本及其转送液至1 ml匀将器中,轻轻研磨8~10次后,用灭菌滴管,吸取组织混匀液,置于分离培养基上,用接种环作分段分离,置于35℃,在5%O2、10%CO2、和85%N2的三气培养箱中培养72 h。   3.Hp菌种鉴定:挑取可疑菌落,涂片染色镜检呈革兰染色阴性,菌体细长弯曲呈螺形、S形或海鸥形,氧化酶试验阳性,过氧化氢酶试验阳性,尿素酶试验阳性。采用PCR扩增Hp的UreA基因,上游引物为5_GCCAATGGTAAATTAGTTCC 3,下游引物为5-CTCCTTAATTGTTTTTACAT一3;反应体系为10times;PCR反应缓冲液5.0ul,25um dNTP 1.0ul,10um引物各1.0ul,Taq DNA聚合酶(大连宝生物技术有限公司)1.O U,模板DNA(100 ng/uL)1.Oul,加无菌去离子水至50ul。反应条件为94℃5 min;94℃ 30 s,52℃,45 s,72℃ 45 s,35个循环;72℃延伸5 min,1%琼脂糖凝胶电泳30 min后,观察结果。   4.左氧氟沙星药敏试验:将Hp菌株用灭菌0.9%氯化钠溶液制成3个麦氏单位的菌悬液。使用棉签浸入菌悬液.分三个方向涂抹平皿表面。凉干10~15 min,放置E—test纸条。微需氧三气培养箱中培养3~5 d后观察结果。判断标准根据文献[5—8],最低抑菌浓度(MIc)ge;1.0ug/ml为耐药。   5.PCR扩增Hp的gyrA基因:根据J99标准菌株的基因组序列(AE001439)采用Primer 5.0   设计引物扩增gyrA基因,引物为gyrA—F:5rsquo;一TTTCTTTCAATCTTACAAA ATAAGC一3rsquo;,gyrA R:3- ATCACCTTGTTTAGTCGCTA一5rsquo;,产物长度为1273 bp。反应体系为10times;PCR反应缓冲液5.Oul,25um dNTP 1.0ul,10um引物各1.0ul,Taq DNA聚合酶(大连宝生物技术有限公司)1.0 U,模板DNA(100ng/ul)1.0 ul,加无菌去离子

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