罗氏沼虾诺达病毒的核酸检测及其部分序列分析.PDFVIP

第 20 卷 　第 1 期 病　　毒　　学　　报 Vol. 20 　　No. 1 　　　　　　　　　　　　 　　　　　　　　　　　　 2 0 0 4 年 3 月 CHINESE JOURNAL OF VIROLO GY Mar. 　2 0 0 4 罗氏沼虾诺达病毒的核酸检测及其部分序列分析 1 1 1 2 2 石正丽 ,解云礼 ,汤显春 ,Sri Widada Joannes ,Bonami JeanRobert ( 1 中国科学院 　武汉病毒研究所分子病毒学重点实验室 ,无脊椎动物病毒学联合开放实验室 ,武汉 　430071 ; 2. UMR 5098 ,DRIM ,CNRS/ IFREMER/ UM2 ,cc - 80 ,Place Eugene Bataillon ,34095 ,Montpellier ,France) ( ) 摘要 :根据安替列群岛分离的罗氏沼虾诺达病毒株基因组序列 M rNVant ,制备特异性核酸探针 ,设计特异性引 ( ) 物 ,用点杂交和 RTPCR 的方法检测在中国境内分离的罗氏沼虾诺达病毒 M rNVchin 。点杂交的方法可以检测 出少于26ng 的患肌肉白浊症的组织样品中的病毒 ,或少于 2 5ng 的病毒 RNA 样品 ; RT - PCR 可以检测出少于 25p g 的 RNA 样品。扩增的 M rNVchin RNA1 序列长 858 个核苷酸 ,与 M rNVant 的核苷酸一致率为 957 % ,两 者翻译后的氨基酸序列的一致率为 997 % 。扩增的 M rNVchin RNA 2 序列长1 121个核苷酸 ,与 M rNVant 的核 苷酸一致率为 92 % ,两者翻译后的氨基酸序列的一致率为 932 % 。因此 , M rNVant 和 M rNVchin 应属于同一种 病毒的不同分离株。用两株罗氏沼虾诺达病毒的 RNA 聚合酶序列与其它 6 株诺达病毒 RNA 聚合酶序列比较后 构建的进化树中 ,罗氏沼虾诺达病毒与Alphanodavirus 的亲缘关系近于与Betanodavirus 的亲缘,组成了一个新的分支。 关键词 :罗氏沼虾 ;诺达病毒 ;点杂交 ;RT - PCR ;序列分析 ( ) 中图分类号:SP45. 4 　　文献标识码 :A 　　文章编号 :1000 - 8721 2004 01 - 0062 - 05 ( ) 　　罗氏沼虾 M acrobrachium rosenbergii 是东南 cDNA 文库探针和特异引物检测罗氏沼虾诺达病毒 亚和加勒比国家淡水养殖品种。20 世纪 80 年代 中国分离株感染的情况以及两株诺达病毒部分序列 末 ,Nash 等人[1 ] 报道了一种罗氏沼虾肌肉白浊病 , 比较的结果。 在肌肉组织内观察到病毒样颗粒。到 20 世纪 90 年 代 ,类似病害出现在中国台湾、法属瓜特罗普岛