BLUP法在畜禽育种中的应用.doc

BLUP法在畜禽育种中的应用 BLUP法在畜禽育种中的应用 黄冬维张元跃(湖南农业大学动物科技学院410128) 谭伟明(湖南省益阳市畜牧水产局413000) 摘要:BLUP即最佳线性无偏预测(BestLinearUnbiasedPrediction)是目前应用最广泛的家畜遗传评定方法, 在现今畜禽场的育种实际当中应用最广.本文简单介绍了BLUP法的基本原理和应用要求以及其优缺点,并阐述 其在畜禽中的应用现状和发展前景. 关键词:BLUP;动物模型;育种;应用 BLUP即最佳线性无偏预测(BestLinearUnbiasedPredie. tion),是一种先进的动物育种值估计方法.传统的育种值估 计方法主要是选择指数法.它有两个缺陷.一是没有对系统 环境效应,非遗传效应进行有效校正;二是不能充分利用所 有亲属的信息.为克服以上缺陷,美国学者Henderson于 1948年提出BLUP方法.BLUP在本质上是选择指数法的一 个推广.但它能对系统环境效应进行估计和校正.而当时由 于计算条件的限制.BLUP法并未用到育种实践中.到了20 世纪70年代.数理统计学及计算机技术的快速发展,使 BLUP法的实际应用成为可能,1972年Henderson又重新提 出BLUP法并对它作了系统阐述,从而引起世界各国育种工 作者的广泛关注.纷纷开展了对BLUP的系统研究,并逐渐 将它用于育种实践.目前BLUP已成为世界各国(尤其是畜 牧业发达国家)家畜遗传评定的规范方法. 1BLUP的基本原理和应注意的问题 1.1BLUP的基本原理 BLUP本身实际上可看作是一个一般性的统计学估计方 法.但它特别适合用于估计家畜的育种值.在应用BLUP方 法时.首先要根据资料的性质建立适当的模型.目前在育种 实践中应用普遍的是动物模型.动物模型是一系列具有不同 结构的混合线性模型.BLUP一般混合模型可写成如下形式 Y=Xb+Zu+e(1) 式中Y为观察值向量,b为未知固定效应向量,u为未知 随机效应向量.e为随机剩余效应向量,x和z分别为已知 固定因子b和随机因子u的关联矩阵.且E(Y)=Xb,E (u):0,E(e)=0,Var(u):G,Var(e):R, Cov(u,e):0,Var(Y):ZGZ+R=V,Cov(Y, u):ZG,Cov(Y,e):R. 需对该模型中的固定效应b和随机效应u进行估计.对 随机效应U的估计称为预测.所谓BLUP法,就是按照最佳 线性无偏的原则去估计b和u.经过一系列数学推算可得 :(XV—lx)一xV—lY(2) 这就是b的广义最小二乘估计值 :GZV—l(Y—Xb)(3) 在式(2)和式(3)中,由于V的维数与Y中的观察值 个数相等.当观察值个数较多时,V变得非常庞大,观察值 向量Y的方差协方差矩阵V的逆矩阵V—l在育种实践中的 计算就非常困难或根本不可能实现.为此Henderson提出了 和的另一种解法——混合模型方程组法(MME).’ [z一.㈤ 所得和与式(2)和式(3)推算值相符,而在计算上 用式(4)比用式(2)和式(3)更为简易.1987年MISZ— TAL提出等价模型利用使计算简便化的不直接建立方程的迭 代求解法的一种模型,简化了计算,使得BLUP方法得到了 丰富和发展.1996年张元跃提出了一种直接利用分子亲缘关 系矩阵计算BLUP值的方法.其主要特点是显着减少BLUP 的计算量和计算机的内存空间,为BLUP在大型育种资料中 应用创造了更为有利的条件. 1.2应用BLUP法应注意的问题 在畜禽育种实践当中,应用动物模型BLUP法来提供精 确的育种值无偏估计值需注意如下问题. 所有数据必须完整,正确.在个体遗传评定时,大量的 工作是整理资料,确保数据资料的完整性与正确性,这是对 估计育种值来说最重要的.也是我国BLUP法评定畜禽种用 价值,实行联合育种的软肋.目前在一些规模化,现代化的 种猪场.采用计算机信息系统管理.在这些系统中已嵌入遗 传评估软件,可大大减少整理资料时间.降低出错概率. 建立真实合理的模型.BLUP法估计育种值关键的是根 据现有的畜群生产情况和资料结构建立一个线性混合模型. 这个模型应尽可能地描述真实的情况,同时又不能过于复杂 而使估计的精确性降低或计算困难,估计的准确性和精确性 完全取决于模型是否合理. 模型中随机效应方差组分已知.方差组分估计是遗传参 数估计的基础.而遗传参数是育种值估计和进行育种决策的 重要依据.方差组分或方差组分比值的真值作为总体参数一 般是未知的.只能用估计的遗传参数去代替.对于大群体, 估计的遗传参数较可靠:小群体所估计的遗传参数误差方差 较大,建议采用国外的遗传参数估计值. 用动物模型BLUP预测育种值时必须正确地定义基础群 和加性关系矩阵.实际应用中常会