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IBV分子进展
鸡传染性支气管炎病毒(IBV)的分子生物学研究进展IB简介鸡传染性支气管炎(Avian Infectious Bronchitis ,IB)是鸡的一种急性、高度接触性传染病,本病的易感动物主要是鸡,亦见于鸽等动物,鸡6周龄以内发病率高达90%,死亡率在25%~40%。主要侵害鸡的呼吸系统、泌尿生殖系统和消化系统。本病最早由美国Schalk和Hawn报道,临床以患鸡咳嗽、喷嚏和气管啰音的呼吸道症状为主,之后陆续在各国发生,呈世界性分布。能使成鸡的增重和饲料报酬降低,鸡蛋产量、质量和孵化率下降,并直接导致雏鸡死亡、肾脏病变和输卵管永久性退化。近年来,该病的流行呈上升趋势,尤其肾型IB(主要引起肾脏肿大、尿酸盐沉积)已蔓延至全国各养鸡地区,造成了严重经济损失。IB简介IBV的血清型较多, 常见的有Massachusetts、Connecticat、lowa97、lowa609、Hotle、JMK、Clark333、SE17、Florida、Arkanass99和Australian“T”等。IBV基因组核酸RNA复制的不连续机制及RNA聚合酶的不完全校对机制,使得病毒RNA在复制过程中易发生基因点突变、插入、缺失或重组,造成大量IBV变异株的出现,目前世界上已分离到的IB血清型已达30种之多,不同血清型毒株疫苗之间仅有部分或无交叉保护作用,IB的多血清型性为其免疫预防增加了难度。从以下几方面介绍IBV的研究进展:1、基因组结构2、主要结构蛋白及生物学功能3、复制过程4、变异机制5、鉴定和检测1、IBV的基因组结构IBV属于冠状病毒科,是冠状病毒的代表株。其为正链单股RNA病毒,直径90~200nm,是所有RNA病毒中最大的。病毒有囊膜,表面有放射状排列的杆状纤突。IBV是第一个测定了基因组全部序列的冠状病毒,共有27608个核苷酸组成,长27~30kb,5’端有帽子结构,3’端有poly(A)尾,至少有10个明显的ORF,编码分子量6.7~440K的蛋白,现已确定的ORF的定位次序如下:5’ Cap – 1a -1b – S – 3a – 3b – 3c(E)- M – 5a – 5b – N - Poly(A)- 3’,分别编码病毒的结构蛋白和非结构蛋白。IBV被分为6个区域,由小到大分别被命名为mRNA A~F。2、IBV的主要结构蛋白及生物学功能IBV含三种最主要的结构蛋白:纤突蛋白(Spike Glycoprotein,SGP,即S蛋白)、膜蛋白(Membrane Glycoprotein,MGP,即M蛋白)、核衣壳蛋白(Nucleocapsid Protein,NP,即N蛋白),分别由mRNA E、C、A编码,三种结构蛋白的摩尔比为1:6:15,第四种小膜蛋白(sM)与病毒囊膜有关。病毒的血清型、血凝抑制和大多数的中和抗体均由S1蛋白决定和诱导。2.3 核衣壳蛋白(N)核衣壳蛋白是唯一位于病毒内部的结构蛋白,位于囊膜内与基因组RNA紧密结合的核衣壳上,分子量为46kDa,占病毒蛋白总来那个的40%,在整个基因组的进化过程中相对最为保守。N蛋白在病毒复制 、组装中有重要作用。N蛋白与先导RNA序列相互作用有助于病毒mRNA合成和病毒RNA结合形成螺旋状衣壳结构,使之容易装入病毒壳内。N蛋白还是免疫识别相关靶位,在细胞免疫和体液免疫中起重要作用。3、IBV的复制过程IBV的复制主要在感染细胞的胞浆内完成,毒粒通过囊膜上的S糖蛋白与靶细胞膜上的特异受体结合,并吸附在细胞表面,以细胞膜与病毒囊膜融合或内吞的方式进入细胞。3.1 IBV基因组的复制病毒基因组一旦进入细胞,便在胞浆内完成其生物学过程。作为一种正链RNA病毒,IBV进入胞浆后首先是让病毒基因组RNA与细胞核糖体结合,从5’端翻译病毒特异的早期依赖于RNA的RNA聚合酶。mRNA的复制不需要细胞核的功能,而是按照特殊的先导-引物转录模式,该RNA聚合酶使病毒的正链基因组RNA转录出一条全长的互补负链RNA,其5’端有一段Poly(U)序列。然后以负链RNA为模板,通过另外一种依赖RNA的RNA聚合酶进一步转录出新的正链基因组RNA(mRNA F)和一套5个亚基因组mRNA(mRNA E~A)。3.1 IBV基因组的复制先导-引物转录模式(leader-primered transcription):先导RNA(即先导序列)从负链RNA 3’端转录出来后与模板链(即负链RNA)分离,但继续与RNA聚合酶保持联系。该先导物-聚合酶复合物继续向模板链下游移动,当遇到与先导RNA互补的序列时,以此为识别信号,重新结合模板链,并以先导RNA作为引物,转录出一条亚基因组mRNA。经过上述不同mRNA起始位点的结合,结果得到一套长度递减的mRNA。3.1 IBV基因组的
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