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三叶悬钩子自然居群遗传多样性的ISSR 分析
园 艺 学 报 2012 ,39 (11):2142 –2150 http: // www. ahs. ac. cn
Acta Horticulturae Sinica E-mail: yuanyixuebao@126.com
三叶悬钩子自然居群遗传多样性的 ISSR 分析
1,2 1,* 2 1 1 1
和志娇 ,和加卫 ,程在全 ,杨正松 ,杨洪涛 ,和文佳
1 2
(云南省农业科学院高山经济植物研究所,云南丽江 674100 ; 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所,昆
明 650223 )
摘 要:利用 ISSR 分子标记对云南特有植物三叶悬钩子(Rubus delavayi Fanch. )的 12 个居群共 248
个个体进行了遗传多样性分析。结果表明:16 个 ISSR 引物共扩增到 199 个位点,其中 185 个是多态性位
点,占 92.96% 。三叶悬钩子居群具有很高的遗传多样性水平,在物种水平上平均每个位点的多态位点百
分率(PPB )为97.99%,有效等位基因数(Ae )为 1.427,Nei’s 遗传多样性(H )为0.267,Shannon’s 多
态信息指数(I )为0.417 ;在居群水平上PPB 为 62.10%,Ae 为 1.289,H 为 0.177,I 为 0.275 。居群间基
因分化系数 Gst = 0.3351 ,与AMOVA 分析的居群间遗传变异量占总量的 33.03%相近,说明三叶悬钩子居
群间存在一定程度的遗传分化。居群间遗传分化占总遗传变异的 33.51%,居群内的遗传变异为 66.49%,
基因流(Nm )为0.9923 。通过Mantel 检测,居群间的遗传距离与地理距离不存在相关性。UMPGA 聚类
分析和二维主成分分析(PCA )结果一致。导致居群内高遗传变异水平原因主要是有限的基因流,而居群
间较低的遗传多样性水平可能与生态破坏和生物入侵有关。
关键词:三叶悬钩子;ISSR ;遗传多样性;遗传分化
中图分类号:S 663.2 文献标志码:A 文章编号:0513-353X (2012 )11-2142-09
Genetic Diversity in the Natural Populations of Rubus delavayi
Demonstrated by Inter-simple Sequence Repeats
1,2 1,* 2 1 1
HE Zhi-jiao ,HE Jia-wei ,CHENG Zai-quan ,YANG Zheng-song ,YANG Hong-tao ,and
1
HE Wen-jia
1
(Institute of Alpine Economic Plant ,Yunnan Academy of Agricultural Sciences,Lijiang ,Yunnan 674100 ,China;
2Research Institute of Biotechnology Genetic Germplasm ,Yunnan Academy of Agricultural Sciences,Kunming 650223 ,
China)
Abstract :Genetic diversity of 248 individuals from 12 natural populations of Rubus delavayi Fa
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